我试图确定两组6列之间的成对的皮尔森相关系数和显着性(p值) .
我正在使用以下脚本:
output <- matrix(dim(data2)[1]*4,dim(data2)[1],4)
for (i in dim(data)[1]){
r<-cor.test(data[i,c(2:7)],data[i,c(9:14)],method="pearson")
output[i,3]<-r$p.value
output[i,4]<-r$estimate
output[i,1]<-data[,1] # target geneID
output[i,2]<-data[i,8] # miRNAID
}
colnames(output) <- c("geneID","miRNAID","p-val","corr")
head(output)
但我对数据矩阵中的向量类型有疑问
我非常感谢您对此问题的意见 .
谢谢V
1 回答
我想知道你是否想这样做:
我不确定你是否想要这个或其他东西,因此只有基因数据,但代码可以很容易地采用mri .
备注:您可以根据组合制作一个id矢量 .