我创建了一个函数,调用它来读入然后返回一个data.table:
read.in.data <- function(filename)
{
library(data.table)
data.holder<-read.table(filename, skip=1)
return(data.table(data.holder))
}
我注意到从观察我的RAM作为函数进程,R似乎分两步处理它(或者至少这是我对正在发生的事情的最佳猜测) . 例如,当我加载一个1.5 GB的文件(15列,每行总共136个字符)时,R似乎1)读入数据并使用1.5 GB的RAM,然后2)使用另一个1.5 GB的RAM回报 .
是否有一些技巧来创建一个函数来创建data.table(或data.frame)并返回data.table而不需要在内存中重复?或者我必须对创建表的函数中的data.table进行所有处理吗?
观察:如果我连续两次运行此代码,则不清除内存;因为我只有8 GB的RAM,所以功能失败了 . 如果我跳过在变量中存储“read.table”的步骤(如下所示),我没有任何好处 . 我不想以任何方式这样做,因为我希望能够在返回之前清理data.table . 修复我的问题也可以让我处理更大的文件,而不会耗尽内存 .
short.read.trk <- function(fntrk)
{
library(data.table)
return(data.table(read.table(fntrk, skip=1)))
}
1 回答
如果节省的内存大部分都是您所追求的,您可以一次将其转换为一列:
(另)
它不会更快,事实上它可能更慢 . 但它应该少浪费内存 .