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f2py与fortran netcdf

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我正在尝试使用f2py来编译一些使用netcdf库的fortran代码 . 编译似乎工作，但当我尝试在python中导入模块时，我收到错误消息：

Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: ./cdfio_simple.so: undefined symbol: netcdf_mp_nf90_get_var_2d_fourbytereal_

编译期间还有以下输出：

In: :cdfio_simple:cdfio_simple.f90:cdfio_simple
get_useparameters: no module netcdf info used by cdfio_simple

我试图使用的代码是（注意这是用于演示问题的简化代码）：

MODULE cdfio_simple
 USE netcdf 

  PRIVATE
  PUBLIC  getvar

CONTAINS
  FUNCTION  getvar (cdfile,cdvar)

    CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdfile,     &   ! file name
         &                          cdvar           ! variable 
    REAL(KIND=4), DIMENSION(1442,1021) :: getvar      ! 2D REAL

    !! * Local variables
    INTEGER :: ncid, id_var
    INTEGER :: istatus 
    CHARACTER(LEN=300) :: clvar

!f2py INTENT(in):: cdfile, cdvar

    clvar=cdvar

    istatus=NF90_OPEN(cdfile,NF90_NOWRITE,ncid) 

    istatus=NF90_INQUIRE(ncid,unlimitedDimId=id_dimunlim)
    istatus=NF90_INQ_VARID ( ncid,clvar,id_var)
    istatus=NF90_GET_VAR(ncid,id_var,getvar)

    istatus=NF90_CLOSE(ncid)
    getvar(:,:)=1

  END FUNCTION getvar

END MODULE cdfio_simple

要编译它我使用命令：

f2py --fcompiler=intelem -c -I/usr/local/netcdf/include/ -L/usr/local/netcdf/lib -lnetcdff --f90flags=-fPIC -m cdfio_simple cdfio_simple.f90

有谁知道我怎么能让它正常工作？在此先感谢您的任何建议 .

蒂姆

python fortran netcdf f2py

1 回答

  • 3

    编译器中的“no module netcdf”错误消息可能表示存在以下任一问题：

    • / usr / local / netcdf / include /中没有安装netcdf.mod模块文件，它应该作为netcdf-fortran软件安装的一部分安装

    • 您使用的Fortran编译器与用于创建该目录中安装的netcdf.mod模块文件的编译器不同 . 不同的Fortran编译器具有不同的二进制.mod文件格式 .

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