我正在尝试使用 raster::extract(raster,spatialpolygons) 来源脚本，因此它会打印有关用于提取的多边形的消息 . 该文件的最终输出是我想要显示的ggplot，但我不希望显示来自R的任何消息 .
```{r percent of avg, echo=FALSE,message=FALSE,warning=FALSE,fig.width=15}
source('src/analysis/extract_huc4_elev.R')
没有任何块选项回显，消息或警告似乎抑制此输出 . 如果我使用 `include=F` 那么情节不会显示 .
编辑：我有一个打印声明，所以解释其中一些： - 和一些额外的调查发现它实际上是这一行：
```java
> huc4=readOGR('data/gis','UpperCRB')
## OGR data source with driver: ESRI Shapefile
## Source: "data/gis", layer: "UpperCRB"
## with 8 features
## It has 9 fields
并且您可以使用以下命令隐藏脚本中的消息：
> huc4=readOGR('data/gis','UpperCRB',verbose=F)
我仍然希望有一种方法可以在markdown输出中隐藏所有脚本消息，例如在这种情况下，我可以更易于维护（这是我的第一个可重复的报告） - 这意味着当我正在编写脚本本身时，我仍然希望看到这些消息（打印语句，详细输出等） .
另外，这是 sessionInfo() 以防万一：
## R version 3.2.2 (2015-08-14)
## Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
## Running under: OS X 10.9.5 (Mavericks)
##
## locale:
## [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
##
## attached base packages:
## [1] parallel stats graphics grDevices utils datasets methods
## [8] base
##
## other attached packages:
## [1] ncdf4_1.13 gstat_1.0-26 doMC_1.3.3 iterators_1.0.7
## [5] foreach_1.4.2 ipred_0.9-5 MASS_7.3-44 rgdal_1.0-7
## [9] readr_0.1.1 dplyr_0.4.3 plyr_1.8.3 tidyr_0.3.1
## [13] raster_2.4-20 sp_1.2-0 ggplot2_1.0.1
##
## loaded via a namespace (and not attached):
## [1] Rcpp_0.12.1 formatR_1.2.1 xts_0.9-7 class_7.3-13
## [5] tools_3.2.2 rpart_4.1-10 digest_0.6.8 evaluate_0.8
## [9] gtable_0.1.2 lattice_0.20-33 DBI_0.3.1 yaml_2.1.13
## [13] prodlim_1.5.5 proto_0.3-10 stringr_1.0.0 knitr_1.11
## [17] grid_3.2.2 nnet_7.3-11 spacetime_1.1-4 R6_2.1.1
## [21] survival_2.38-3 rmarkdown_0.8 lava_1.4.1 reshape2_1.4.1
## [25] magrittr_1.5 intervals_0.15.1 codetools_0.2-14 scales_0.3.0
## [29] htmltools_0.2.6 splines_3.2.2 assertthat_0.1 colorspace_1.2-6
## [33] stringi_0.5-5 lazyeval_0.1.10 munsell_0.4.2 FNN_1.1
## [37] zoo_1.7-12
2 回答
基于@RobertH评论http://yihui.name/knitr/demo/output的链接，我测试并发现你可以使用
results='hide',fig.keep='high',fig.show='asis'并且文本输出如print（）和cat（）语句不会在html中打印但图表仍然可以通过！在搞砸了这个之后，我意识到另一种方法是使用
include=F并在R脚本中将绘图保存到磁盘然后在r块之外使用