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r shiny - 将shinyDirChoose文件夹中的所有文件上传到服务器

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我用 shinyDirChoose 保存了用户定义文件夹的路径 . 现在我想从该用户的文件夹上传文件，但我无法弄清楚如何做到这一点 . 1）所有在服务器端？ 2）以某种方式将文件路径提供给 fileInput ？

这是我为应该上传的三个文件构建文件路径的方法 .

### ui end, to browse to desired folder
ui = fluidPage(shinyDirButton('directory', 'Folder select', 'Please select a folder'))

### extracting the folder path
server = function(input, output, session) {
    volumes <- getVolumes()
    shinyDirChoose(input, 'directory', roots=volumes, session=session)
    path1 <- reactive({
       return(print(parseDirPath(volumes, input$directory)))
    })

### constructing the 3 file paths
datpat <- renderText({
    req(nchar(path1())>0)
    datpat <- paste0(path1(),"/data.csv")
  })
vispat <- renderText({
    req(nchar(path1())>0)
    vispat <- paste0(path1(),"/visit.csv")
  })
statpat <- renderText({
   req(nchar(path1())>0)
   statpat <- paste0(path1(),"/statvisit.csv")
})

所以现在我有这些路径，但是如何使用它们将相关内容上传到服务器？遗憾的是，一个简单的 read.csv 没有做到这一点 .

EDIT - but not there yet...

在@SBista提供的帮助下进一步工作，我想我正在接近我的目标，但是看下面的代码......

volumes <- getVolumes()
shinyDirChoose(input, 'directory', roots=volumes, session=session)
path1 <- reactive({
  return(print(parseDirPath(volumes, input$directory)))
})

observe({
  if(!is.null(path1)){
    ### vis1
    vis1 <- reactive({
      datpat <- paste0(path1(),"/visit.csv")
      vis <- read.csv(datpat, header = input$header, sep = input$sep, quote = input$quote,
                      stringsAsFactors = FALSE)
      vis
    })
    ### dataruw1
    dataruw1 <- reactive({
      datpat <- paste0(path1(),"/data.csv")
      dataruw <- read.csv(datpat, header = input$header, sep = input$sep, quote = input$quote,
                          stringsAsFactors = FALSE)
      dataruw
    })
  }
})

不幸的是，似乎没有生成 dataruw1 和 vis1 ，因为我在尝试使用 dataruw1() 和 vis1() 的实际数据时遇到了'could not find function'错误 . 我错过了什么？任何的想法？非常感谢提前！

r shiny

2 回答

  • 2

    很高兴找到了解决方案！非常感谢SBista，尽管我做的有点不同 . 如果您浏览到包含 data.csv 文件的文件夹，下面的代码不仅仅是一个块（如我原来的帖子中所示），而是功能齐全的 .

    library(shiny)
library(shinyFiles)
library(htmltools)


##############################################################################

ui = navbarPage(
  HTML("Title"),
  tabPanel(HTML("<font size=3>Start</font>"),
           sidebarPanel(width = 2,
                        shinyDirButton('directory', 'Folder select', 'Please select a folder'),
                        checkboxInput('header', 'Header', TRUE),
                        radioButtons('sep', 'Separator', c(Comma=',',Semicolon=';',Tab='\t'), selected=';'),
                        radioButtons('quote', 'Quote', c(None='','Double Quote'='"','Single Quote'="'"), selected='"')),
           mainPanel(
             fluidRow(
               column(6, tags$b(textOutput("text")))),
             tags$hr(),
             fluidRow(
               column(6, dataTableOutput("table"))
             )
           )
  )
)

server = function(input, output, session) {

  volumes <- getVolumes()
  shinyDirChoose(input, 'directory', roots=volumes, session=session)
  path1 <- reactive({
    return(print(parseDirPath(volumes, input$directory)))
  })

  dataruw1 <- eventReactive(input$directory, {
    datpat <- paste0(path1(),"/data.csv")
    dataruw <- read.csv(datpat, header = input$header, sep = input$sep, quote = input$quote,
                        stringsAsFactors = FALSE)
    dataruw
  })

  output$text <- renderText({
    path1()
  })

  output$table <- renderDataTable({
    dataruw1()
  })

}

shinyApp(ui = ui, server = server, options = list(launch.browser=TRUE))
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  • 1

    我修改了您的应用以证明您可以使用 read.csv 上传文件 . 为了演示，我只从文件夹中读取一个文件，并在数据表中显示读取数据帧 .

    library(shiny)
  library(shinyFiles)

  ### ui end, to browse to desired folder
  ui = fluidPage(shinyDirButton('directory', 'Folder select', 'Please select a folder'),
                 tableOutput(outputId = "datpat")
                 )

  ### extracting the folder path
  server = function(input, output, session) {
    volumes <- getVolumes()
    shinyDirChoose(input, 'directory', roots=volumes, session=session)
    path1 <- reactive({
      return(print(parseDirPath(volumes, input$directory)))
    })

    ### constructing the 3 file paths
    observe({
      if(!is.null(path1)){
        output$datpat <- renderTable({
          req(nchar(path1())>0)
          datpat <- paste0(path1(),"/data.csv")
          dat <- read.csv(datpat)
          dat
        })

      }
    })

  }

  shinyApp(ui = ui, server = server)

    希望能帮助到你！

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