下面我提供了一些我一直在研究的代码片段 . 我已成功读取字符串作为表格 . 我希望使用中位数（）函数存在我的表的一些子集 . 根据我所做的研究和我自己的经验，median（）没有为data.frame定义行为，也没有定义data.frame的子集 . 因此，为了使我的问题适合某些定义的行为，我试图将我想要的子集投射到矢量中 . 但是，即使使用as.vector投射我想要的子集，我仍然有一个data.frame . 当我尝试调用中位数时，我得到“参数不是数字或逻辑：返回NA” .
我自己玩了很多，并试图在这里和其他地方找到信息 . 作为一个说明，我已尝试在此线程R-friendly way to convert R data.frame column to a vector?上的重复解决方案中列出的方法，并取得了与现在相同的结果 . 我不太关心我是如何做到这一点的;随意提出其他方法 .
感谢您的时间 .
for(i in 1:length(text_array)){
temp= read.table(textConnection(text_array[i]), sep="\t",row.names=NULL, header= FALSE, fill=TRUE)
value=""
#we are now going to process temp and add it
cur_DS=coll_data_sets[i]
#median is the value that we are going to insert into the result array.
#currently the logic behind it is not implemented.
#the value will be the median of state1 divided by the median of state2.
t_states=vector(length=ncol(temp))
for(j in 1:ncol(temp)){
t_states[j]=toString(temp[2,j])
}
t_states=(unique(t_states))
#this logic is current is set to reject data from more than one state.
# It will also reject anything that appears to lack state data.
if(length(t_states) != 2){
value=NA
}else{
s1_expr=as.vector(x=(temp[3, temp[2,]==t_states[1]]))
s2_expr=as.vector(x=temp[3, temp[2,]==t_states[2]])
print(class(s1_expr))
# med1= (median(s1_expr))
# med2= (median(s2_expr))
# if(is.na(med1[1]) || is.na(med2[1])){
# value=-1
}#else{
# value=med1[1]/med2[1]
# print(value)
# }
}
[1] "data.frame"
[1] "data.frame"
[1] "data.frame"
以下是'temp'的示例值：
V1 V2 V3 V4
1 GSM506899 GSM506900 GSM506901 GSM506902
2 wild type wild type Zbtb20 null Zbtb20 null
3 99.3 98.24 66.2 102.42
4 55.8 20.11 22.9 16.98
5 159.6 63.46 102.5 67.17
6 166 54.73 215 49.46
1 回答
数据框是列表 . 即使您只选择一行数据，它仍然是一个列表 .
试试
unlist. （假设"row"中的所有值当然都是数字 . 如果不是，那么你就会遇到更大的问题 . ）