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Conda环境没有出现在Jupyter Notebook中

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我安装了Anaconda（使用Python 2.7），并在名为 tensorflow 的环境中安装了Tensorflow . 我可以在该环境中成功导入Tensorflow .

问题是Jupyter Notebook无法识别我刚刚创建的新环境 . 无论我从GUI Navigator或命令行 within tensorflow env启动Jupyter Notebook，菜单中只有一个名为 Python [Root] 的内核，并且无法导入Tensorflow . 当然，我多次点击该选项，保存文件，重新打开，但这些没有帮助 .

奇怪的是，当我打开Jupyter首页上的 Conda 标签时，我可以看到这两个环境 . 但是，当我打开 Files 标签，并尝试 new 笔记本时，我仍然只有一个内核 .

我看了这个问题：Link Conda environment with Jupyter Notebook但是我的电脑上没有 ~/Library/Jupyter/kernels 这样的目录！此Jupyter目录只有一个名为 runtime 的子目录 .

我真的很困惑 . Conda环境是否应该自动成为内核？ （我按照https://ipython.readthedocs.io/en/stable/install/kernel_install.html手动设置了内核，但被告知找不到 ipykernel . ）

anaconda jupyter jupyter-notebook conda

8 回答

  • 16

    @ HarshaManjunath的评论提到当使用Anaconda3（或Miniconda3）时，你需要在conda环境中安装 nb_conda （除了 jupyter ）：

    (py35) $ conda install nb_conda

    注意这个does not currently work with python 3.6 environments . 该软件包的信息确实说有一个python 3.6版本，它只是不起作用 .

    $ conda info nb_conda
...
nb_conda 2.0.0 py36_0
---------------------
file name   : nb_conda-2.0.0-py36_0.tar.bz2
name        : nb_conda
version     : 2.0.0
build string: py36_0
build number: 0
channel     : defaults
size        : 30 KB
arch        : x86_64
date        : 2016-12-20
license     : BSD
md5         : 24d433439f2fdd1d27e49c27688c2589
noarch      : None
platform    : linux
url         : https://repo.continuum.io/pkgs/free/linux-64/nb_conda-2.0.0-py36_0.tar.bz2
dependencies:
    _nb_ext_conf
    nb_conda_kernels
    notebook >=4.2
    python 3.6*

    要在Jupyter笔记本中使用python 3.6，可以在python 3.6环境中运行 jupyter . 您将无法从Jupyter中查看或切换到其他环境 .

    $ conda create -n py36_test -y python=3.6 jupyter
$ source activate py36_test
(py36_test) $ which jupyter
/home/schowell/anaconda3/envs/py36_test/bin/jupyter
(py36_test) $ jupyter notebook

    请注意，我在这个笔记本中运行Python 3.6.1：
    enter image description here

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  • 5

    令人讨厌的是，在 tensorflow 环境中，您可以运行 jupyter notebook without installing jupyter in that environment . 赶紧跑

    (tensorflow) $ conda install jupyter

    现在， tensorflow 环境应该可以在任何 conda 环境中启动的Jupyter笔记本中看到，如 Python [conda env:tensorflow] .

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  • 51

    我们在这个问题上遇到了很多困难，这对我们有用 . 如果您使用conda-forge channel，请务必确保使用 conda-forge 中的更新软件包，即使在 Miniconda root环境中也是如此 .

    所以安装Miniconda，然后执行：

    conda config --add channels conda-forge --force
conda update --all  -y
conda install nb_conda_kernels -y
conda env create -f custom_env.yml -q --force
jupyter notebook

    并且您的自定义环境将在Jupyter中显示为可用内核，只要 ipykernel 列在 custom_env.yml 文件中进行安装，如下例所示：

    name: bqplot
channels:
- conda-forge
- defaults
dependencies:
- python>=3.6
- bqplot
- ipykernel

    只是为了证明它适用于一堆自定义环境，这里是Windows的屏幕抓取：

    enter image description here

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  • 34

    这是令人沮丧的，我的问题是在新构建的conda python36环境中，jupyter拒绝加载“seaborn” - 即使seaborn安装在该环境中 . 它似乎能够从同一环境中导入大量其他文件 - 例如numpy和pandas但不是seaborn . 我在这里和其他线程上尝试了许多修复但没有成功 . 直到我意识到Jupyter没有从该环境中运行内核python，而是将系统python作为内核运行 . 尽管在环境中已经存在一个像样的内核和kernel.json . 只有在阅读了ipython文档的这一部分之后：https://ipython.readthedocs.io/en/latest/install/kernel_install.html#kernels-for-different-environments并使用以下命令：

    source activate other-env
python -m ipykernel install --user --name other-env --display-name "Python (other-env)"

    我能够很好地完成一切 . （我实际上并没有使用-user变量） .

    我还没想到的一件事是如何将默认python设置为“Python（other-env）” . 目前，从主屏幕打开的现有.ipynb文件将使用系统python . 我必须使用内核菜单“更改内核”来选择环境python .

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  • 252

    只需在新环境中运行 conda install ipykernel ，只有这样你才能获得带有这个环境的内核 . 即使您在每个env中安装了不同的版本，它也不会再次安装jupyter笔记本 . 您可以从任何环境中启动笔记本，您将能够看到新添加的内核 .

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  • 0

    我遇到了同样的问题，我的新conda环境 myenv 无法被选为内核或新笔记本 . 从env中运行 jupter notebook 给出了相同的结果 .

    我的解决方案，以及我了解Jupyter笔记本如何识别conda-envs和内核：

    使用conda将jupyter和ipython安装到 myenv ：

    conda install -n myenv ipython jupyter

    之后，在任何列出 myenv 的env之外运行 jupter notebook 作为内核以及我之前的环境 .

    Python [conda env:old]
Python [conda env:myenv]

    激活环境后运行笔记本：

    source activate myenv
jupyter notebook

    隐藏我所有的其他环境内核，只显示我的语言内核：

    python 2
python 3
R
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  • 6

    我不认为其他答案正在发挥作用，因为conda停止自动将环境设置为jupyter内核 . 您需要以下列方式为每个环境手动添加内核：

    source activate myenv
python -m ipykernel install --user --name myenv --display-name "Python (myenv)"

    如此处所述：http://ipython.readthedocs.io/en/stable/install/kernel_install.html#kernels-for-different-environments另见this issue .

    附录：你应该可以使用 conda install nb_conda_kernels 安装 nb_conda_kernels 软件包以自动添加所有环境，请参阅https://github.com/Anaconda-Platform/nb_conda_kernels

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  • 78

    我必须运行前3个答案中提到的所有命令才能使其正常工作：

    conda install jupyter
conda install nb_conda
conda install ipykernel
python -m ipykernel install --user --name mykernel
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