我该如何处理“包'xxx'不可用（对于R版x.y.z）”警告？-Java 学习之路

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我尝试使用安装包

install.packages("foobarbaz")

但收到了警告

Warning message:
package 'foobarbaz' is not available (for R version x.y.z)

为什么R不认为包装可用？

另请参阅这些问题，参考此问题的具体实例：

16 回答

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另一个小的补充，同时尝试使用docker镜像测试旧的R版本 rocker/r-ver:3.1.0
- 默认 repos 设置为 MRAN ，这无法获得许多包 .
- 该版本的R没有 https ，因此，例如： install.packages("knitr", repos = "https://cran.rstudio.com") 似乎有效 .
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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我遇到的一件事是我的linux发行版提供的R版本（Ubuntu 14.04提供的R版本3.0.2）对于CRAN上可用的最新版本的软件包来说太旧了（在我的情况下， plyr 版本1.8 . 3截至今日） . 解决方案是使用我的发行版的打包系统，而不是尝试从R安装（ apt-get install r-cran-plyr 得到我的 plyr 版本1.8.1） . 也许我本可以尝试使用 updateR() 更新R，但我是'm afraid that doing so would interfere with my distribution'的包管理器 .

回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
-3
在最新的R（3.2.3）中有一个错误，有时会阻止它找到正确的包 . 解决方法是手动设置存储库：
```
install.packages("lubridate", dependencies=TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')
```
在other question找到解决方案
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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1. You can't spell

要测试的第一件事是你正确拼写包的名称吗？包名称在R中区分大小写 .

2. You didn't look in the right repository

接下来，您应该检查包是否可用 . 类型
```
setRepositories()
```
另见?setRepositories .

要查看哪些存储库R将查找您的包，并选择一些其他存储库 . 至少，您通常需要选择 CRAN ，如果您使用Windows，则选择 CRAN (extras) ，如果您执行任何[gen / prote / metabol / transcript]组织生物分析，则需要 Bioc* 存储库 .

要永久更改此项，请在Rprofile.site文件中添加 setRepositories(ind = c(1:6, 8)) 之类的行 .

3. The package is not in the repositories you selected

使用返回所有可用的包
```
ap <- available.packages()
```
另见Names of R's available packages，?available.packages .

由于这是一个大型矩阵，您可能希望使用数据查看器来检查它 . 或者，您可以通过针对行名称进行测试来快速检查包是否可用 .
```
View(ap)
"foobarbaz" %in% rownames(ap)
```
或者，可以在浏览器中查看可用包列表CRAN，CRAN (extras)，Bioconductor，R-forge，RForge和github .

与CRAN镜像交互时可能会收到的另一条警告信息是：
```
Warning: unable to access index for repository
```
这可能表示所选CRAN存储库当前不可用 . 您可以使用 chooseCRANmirror() 选择其他镜像并再次尝试安装 .

包裹可能无法使用的原因有多种 .

4. You don't want a package

也许你真的不想要一个包 . 关于a package and a library或包与数据集之间的区别，常常会感到困惑 .

包装是延伸R的标准材料集合，例如，提供代码，数据或文档 . 库是一个地方（目录），R知道它可以找到它可以使用的包

要查看可用数据集，请键入
```
data()
```
5. R or Bioconductor is out of date

它可能依赖于更新版本的R（或其导入/依赖的其中一个软件包） . 看着
```
ap["foobarbaz", "Depends"]
```
并考虑将R安装更新到当前版本 . 在Windows上，这最容易通过installr包完成 .
```
library(installr)
updateR()
```
（当然，您可能需要先 install.packages("installr") . ）

对于Bioconductor包，您可能需要更新Bioconductor安装 .
```
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("BiocUpgrade")
```
6. The package is out of date

它可能是archived（如果不再维护并且不再通过R CMD check测试） .

在这种情况下，您可以使用install_version()加载旧版本的包
```
library(remotes)
install_version("foobarbaz", "0.1.2")
```
另一种方法是从github CRAN镜像安装 .
```
library(remotes)
install_github("cran/foobarbaz")
```
7. There is no Windows/OS X/Linux binary

由于需要CRAN没有的其他软件，它可能没有Windows binary . 此外，某些软件包仅可通过某些或所有平台的源提供 . 在这种情况下， CRAN (extras) 存储库中可能有一个版本（参见上面的 setRepositories ） .

如果软件包需要编译代码（例如C，C，FORTRAN），那么在Windows上安装Rtools或在OS X上安装伴随XCode的developer tools，并通过以下方式安装软件包的源版本：
```
install.packages("foobarbaz", type = "source")

# Or equivalently, for Bioconductor packages:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("foobarbaz", type = "source")
```
在CRAN上，您可以通过查看描述中的 NeedsCompilation 标志来判断是否需要使用特殊工具从源代码构建包 .

8. The package is on github/Bitbucket/Gitorious

它可能在Github / Bitbucket / Gitorious上有一个存储库 . 这些包需要安装remotes包 .
```
library(remotes)
install_github("packageauthor/foobarbaz")
install_bitbucket("packageauthor/foobarbaz")
install_gitorious("packageauthor/foobarbaz")
```
（与 installr 一样，您可能需要先 install.packages("remotes") . ）

9. There is no source version of the package

虽然您的软件包的二进制版本可用，但源版本是不 . 您可以通过设置关闭此检查
```
options(install.packages.check.source = "no")
```
如this SO answer by imanuelc和?install.packages的详细信息部分所述 .

10. The package is in a non-standard repository

您的包位于非标准存储库中（例如Rbbg） . 假设它合理地符合CRAN标准，您仍然可以使用 install.packages 下载它;您只需指定存储库URL即可 .
```
install.packages("Rbbg", repos = "http://r.findata.org")
```
另一方面，RHIPE不在类似CRAN的存储库中，并且有自己的installation instructions .
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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我有同样的问题（在Linux上）可以解决更改代理设置 . 如果您在代理服务器后面使用_中的 Sys.getenv("http_proxy") 检查配置 . 在我的 ~/.Renviron 中，我有以下行（来自https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200488488-Configuring-R-to-Use-an-HTTP-or-HTTPS-Proxy）导致问题：
```
http_proxy=https://proxy.dom.com:port
http_proxy_user=user:passwd
```
将其更改为
```
http_proxy="http://user:passwd@proxy.dom.com:port"
```
解决了这个问题 . 你可以为 https 做同样的事情 .

当我读到“包xxx不适用于r版-x-y-z”时，这不是第一个想法......

HTH
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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当我使用bioconductor作为源然后调用biocLite时，它几乎总是对我有用 . 例：
```
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("preprocessCore")
```
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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某些版本的 R 和 libcurl 似乎存在问题 . 我在 Mac (R version 3.2.2) 和 Ubuntu (R version 3.0.2) 上遇到了同样的问题，并且在两个实例中都只是通过在 install.packages 命令之前运行它来解决它
```
options(download.file.method = "wget")
```
该解决方案是由朋友提出的，但是，我无法在任何论坛中找到它，因此将答案提交给其他人 .
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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11. R (or another dependency) is out of date and you don't want to update it.

警告这不是最佳做法 .
- 下载包源 .
- 导航到 DESCRIPTION 文件 .
- 使用文本编辑器删除有问题的行，例如
```
Depends: R (>= 3.1.1)
```
- 从本地安装（即从 DESCRIPTION 的父目录安装），例如
```
install.packages("foo", type="source", repos=NULL)
```
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
3
我在安装包“情绪”时遇到了同样的问题 . 开始搜索并尝试了许多命令 . 最后使用以下命令安装包：
```
install_url("http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/sentiment/sentiment_0.2.tar.gz")
```
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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从源代码安装R包时，我忘记了忘了放 repos=NULL . 在这种情况下，错误消息有点误导： package 'foobarbaz' is not available (for R version x.y.z)

问题不在于R的版本，而是 repos 参数 . 我做了 install.packages('path/to/source/code/of/foobarbaz', type='source', repos=NULL) ，在这个场合为我工作 .

希望这有助于某人 .

回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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我通过仔细遵循instructions for installing R在Ubuntu上修复了这个错误 . 这包括：
- 将 deb http://cran.utstat.utoronto.ca/bin/linux/ubuntu trusty/ 添加到我的/etc/apt/sources.list文件中
- 正在运行 sudo apt-get update
- 正在运行 sudo apt-get install r-base-dev
对于第1步，如果您愿意，可以选择任何CRAN下载镜像代替我的多伦多大学 .
回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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当我得到相同的警告时，这是我最终可以在R-3.4.1中安装心理包的方法

1：用Google搜索该包 .

2：手动下载tar.gz扩展名

3：为R中的安装包选择“包存档文件（.zip; .tar.gz）”选项

4：在本地浏览到下载地点并单击安装

您可能会收到一条警告：依赖项'xyz'不适用于该软件包，然后首先从存储库中安装它们，然后执行步骤3-4 .

回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
2

如上所述here（法语），当您的计算机上安装了两个版本的R时，就会发生这种情况 . 卸载最旧的一个，然后再次尝试安装包！它对我来说很好 .

回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00
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这个解决方案可能会破坏R，但这是一个最简单的解决方案，可以在99％的时间内运行

你需要做的只是：

install.packages（'package-name'，repos ='http：//cran.us.r-project.org'）

正如作者所提到的here

回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00

devtools GitHub . 这3行（帮我解决了这个错误）还没有提到：

install.packages("devtools")  # if not already installed
library(devtools)
install_git("https://github.com/profile/foobarbaz_repository")

回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00

这节省了我很多时间调试错误 . 在许多情况下，镜子已经过时了 . 此函数可以使用 https://cran.rstudio.com/ 安装多个包及其依赖项：

packages <- function(pkg){
    new.pkg <- pkg[!(pkg %in% installed.packages()[, "Package"])]
    if (length(new.pkg))
        install.packages(new.pkg, dependencies = TRUE, repos='https://cran.rstudio.com/')
    sapply(pkg, require, character.only = TRUE)
}

packages(c("foo", "bar", "baz"))

回复于 2024-05-03T09:21:14+08:00

我该如何处理“包'xxx'不可用（对于R版x.y.z）”警告？

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