我有矩阵文件,它基本上是跨各种细胞类型的基因之间的spearman相关矩阵 . 所以现在我试图找出哪些基因或基因组的相关值可以说大于0.6,如果我将其设置为我的阈值 . 我怎样才能做到这一点?我正在发布我的数据子集 . 它是一个502 x 502矩阵 .
ACTL6B ACTR5 ACTR6
ACTL6B 1 0.6 -0.4
ACTR5 0.4 1 -0.3
ACTR6 -0.4 -0.3 1
所以我不希望相同的基因组之间的相关性是1.我想要另一个比较 . 比方说, ACTL6B
和 ACTR5
,其相关系数为0.6 . 我想保留这些 Value 观和基因 .
1 回答
这是一个例子:
由于
lower.tri
,对角线和上矩阵中的所有值都将被忽略 .结果: