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pandas read_csv和使用usecols过滤列

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我有一个csv文件,当我使用 usecols 过滤列并使用多个索引时, pandas.read_csv 没有正确使用 .

import pandas as pd
csv = r"""dummy,date,loc,x
   bar,20090101,a,1
   bar,20090102,a,3
   bar,20090103,a,5
   bar,20090101,b,1
   bar,20090102,b,3
   bar,20090103,b,5"""

f = open('foo.csv', 'w')
f.write(csv)
f.close()

df1 = pd.read_csv('foo.csv',
        header=0,
        names=["dummy", "date", "loc", "x"], 
        index_col=["date", "loc"], 
        usecols=["dummy", "date", "loc", "x"],
        parse_dates=["date"])
print df1

# Ignore the dummy columns
df2 = pd.read_csv('foo.csv', 
        index_col=["date", "loc"], 
        usecols=["date", "loc", "x"], # <----------- Changed
        parse_dates=["date"],
        header=0,
        names=["dummy", "date", "loc", "x"])
print df2

我希望df1和df2应该是相同的,除了丢失的虚拟列,但列标记错误 . 此日期也被解析为日期 .

In [118]: %run test.py
               dummy  x
date       loc
2009-01-01 a     bar  1
2009-01-02 a     bar  3
2009-01-03 a     bar  5
2009-01-01 b     bar  1
2009-01-02 b     bar  3
2009-01-03 b     bar  5
              date
date loc
a    1    20090101
     3    20090102
     5    20090103
b    1    20090101
     3    20090102
     5    20090103

使用列号而不是名称会给我带来同样的问题 . 我可以通过在read_csv步骤之后删除虚拟列来解决此问题,但我正在尝试了解出现了什么问题 . 我正在使用熊猫0.10.1 .

编辑:修复错误的 Headers 用法 .

4 回答

  • -3

    这段代码实现了你想要的东西 - 也是它的奇怪和肯定的错误:

    我发现它适用于:

    a)指定 index_col rel . 你真正使用的列数 - 所以在这个例子中它的三列,而不是四列(你放弃 dummy 并从那时起开始计数)

    b) parse_dates 相同

    c)因为显而易见的原因而不是 usecols ;)

    d)在这里我调整了 names 以反映这种行为

    import pandas as pd
    from StringIO import StringIO
    
    csv = """dummy,date,loc,x
    bar,20090101,a,1
    bar,20090102,a,3
    bar,20090103,a,5
    bar,20090101,b,1
    bar,20090102,b,3
    bar,20090103,b,5
    """
    
    df = pd.read_csv(StringIO(csv),
            index_col=[0,1],
            usecols=[1,2,3], 
            parse_dates=[0],
            header=0,
            names=["date", "loc", "", "x"])
    
    print df
    

    打印

    x
    date       loc   
    2009-01-01 a    1
    2009-01-02 a    3
    2009-01-03 a    5
    2009-01-01 b    1
    2009-01-02 b    3
    2009-01-03 b    5
    
  • 67

    首先导入csv并使用csv.DictReader,它易于处理...

  • 8

    @chip的答案完全忽略了两个关键字参数的要点 .

    仅当没有 Headers 并且您希望使用列名而不是整数索引指定其他参数时,才需要

    • names .

    • usecols 应该在将整个DataFrame读入内存之前提供过滤器;如果使用得当,读取后永远不需要删除列 .

    这个解决方案纠正了这些奇怪之处:

    import pandas as pd
    from StringIO import StringIO
    
    csv = r"""dummy,date,loc,x
    bar,20090101,a,1
    bar,20090102,a,3
    bar,20090103,a,5
    bar,20090101,b,1
    bar,20090102,b,3
    bar,20090103,b,5"""
    
    df = pd.read_csv(StringIO(csv),
            header=0,
            index_col=["date", "loc"], 
            usecols=["date", "loc", "x"],
            parse_dates=["date"])
    

    这给了我们:

    x
    date       loc
    2009-01-01 a    1
    2009-01-02 a    3
    2009-01-03 a    5
    2009-01-01 b    1
    2009-01-02 b    3
    2009-01-03 b    5
    
  • 17

    如果您的csv文件包含额外数据,则导入后DataFrame中的列可以是deleted .

    import pandas as pd
    from StringIO import StringIO
    
    csv = r"""dummy,date,loc,x
    bar,20090101,a,1
    bar,20090102,a,3
    bar,20090103,a,5
    bar,20090101,b,1
    bar,20090102,b,3
    bar,20090103,b,5"""
    
    df = pd.read_csv(StringIO(csv),
            index_col=["date", "loc"], 
            usecols=["dummy", "date", "loc", "x"],
            parse_dates=["date"],
            header=0,
            names=["dummy", "date", "loc", "x"])
    del df['dummy']
    

    这给了我们:

    x
    date       loc
    2009-01-01 a    1
    2009-01-02 a    3
    2009-01-03 a    5
    2009-01-01 b    1
    2009-01-02 b    3
    2009-01-03 b    5
    

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