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总结dplyr中的值 - 崩溃RStudio

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dplyr 可以在 data.frame 上执行链式 summarise 操作吗？

我的data.frame有以下结构：

data_df = tbl_df(data)    
data_df %.%
        group_by(col_1) %.%
        summarise(number_of= length(col_2)) %.%
        summarise(sum_of = sum(col_3))

这会导致RStudio遇到 fatal error - R Session Aborted 消息

通常使用 plyr 我会毫无问题地包含这些 summarise 函数 .

UPDATE

数据是here.

代码是：

library(dplyr)

orth <- read.csv('orth0106.csv')
orth_df = tbl_df(orth)


orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure)) %.%
    summarise(SSIs = sum(SSI))
r rstudio dplyr

1 回答

  • 10

    我可以在运行RStudio 0.97.551的Windows 7机器上重现该错误

    这可能是因为你正在调用 summarise 并将其链接到那些不存在的东西上 . 您可以 summarise 使用2个不同的列，就像我在这里所做的那样 .

    url <- "https://raw.github.com/johnmarquess/some.data/master/orth0106.csv"

library(dplyr)

orth <- read.csv(url)
orth_df <- tbl_df(orth)


orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure), SSIs = sum(SSI))

## Source: local data frame [18 x 3]
## 
##    Hospital Procs SSIs
## 1         A   865   80
## 2         B  1069   38
## 3         C   796   24
## 4         D   891   35
## 5         E   997   39
## 6         F   550   30
## 7         G  2598  128
## 8         H   373   27
## 9         I  1079   70
## 10        J   714   30
## 11        K   477   30
## 12        L   227    2
## 13        M   125    6
## 14        N   589   38
## 15        O   292    3
## 16        P   149    9
## 17        Q  1984   52
## 18        R   351   13

    在任何情况下，这似乎是一个RStudio或 dplyr 错误 . 我会向哈德利提出一个问题，因为他可能会关心这两种方式 . https://github.com/hadley/dplyr/issues

    EDIT 这（你的第一个电话）也会导致rgui（windows）和终端崩溃：

    R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)

    这表明Hadley和Romain想要了解的问题是_2848333 .

    为了得到我的第一点，我们运行：

    orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure))

Source: local data frame [18 x 2]

   Hospital Procs
1         A   865
2         B  1069
3         C   796
4         D   891
5         E   997
6         F   550
7         G  2598
8         H   373
9         I  1079
10        J   714
11        K   477
12        L   227
13        M   125
14        N   589
15        O   292
16        P   149
17        Q  1984
18        R   351

    %.% summarise(SSIs = sum(SSI)) 应该在哪里找到 SSI ？

    所以你认为发生的链接失败了 . 据我所知 %.% 与 ggplot2 的工作方式不完全相似但相似 . 在 ggplot2 中，一旦您在初始映射中传递数据，您可以稍后访问它 . 这里％ . ％似乎修改 grab 左块并对其进行操作如下：

    enter image description here

    所以你 grab 了：

    Hospital Procs
1         A   865
2         B  1069
3         C   796
.
.
.
17        Q  1984
18        R   351

    当你使用 %.% summarise(SSIs = sum(SSI)) 并且没有 SSI 时 . 所以想到的类比是serial vs. parallel wiring Christmas lights . %.% = serial ggplot() + = parallel . 这是一个非程序员's understanding of things and the R gurus may come and tell me I' m愚蠢，但现在_2848348已经得到了 .

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