部署闪亮的应用程序时出错-Java 学习之路

我写了一个闪亮的应用程序，它取决于CRAN，bioconductor和Github的一些软件包 . 我想在shinyapps.io上部署它，但得到一些错误 . 首先，我使用shinyapp.io用户指南上的指南 . 只需使用R包"rsconnect"，并使用setAccountInfo设置帐户，然后使用rsconnect :: deployApp部署我的应用程序，但会收到以下错误 .
enter image description here

然后我添加选项（repos = BiocInstaller :: biocinstallRepos（））它允许我在bioconductor上安装包，但我的应用程序也依赖于Github的包，所以得到以下错误 .

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请不要发布图片 . 它对字体大小没有帮助，也没有正确地传达您的问题 . 尝试发布您输入的代码和错误，最后发布sessionInfo（） .

根据您的错误，您可能错过了文档Using your R packages in the cloud .

为了在shinyapps.io上成功安装BioConductor软件包，必须配置repos选项......`

检查您的会话正在使用的存储库
```
getOption("repos")
```
默认情况下，您应该看到 . Bioconductor失踪的地方 .
```
CRAN 
"https://mran.microsoft.com/snapshot/2018-08-01" 
                                       CRANextra 
            "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"
```
您可以在 .Rprofile （R根目录）中进行全局更改 . 或者创建一个新的 .Rprofile . 我更喜欢第二种方式，你可以更好地控制 .

这里的步骤详述Package management in RStudio Connect .

在要部署的app目录中添加 .Rprofile . 复制粘贴以下内容 .
```
# A sample .Rprofile file with two different package repositories

local({
  r <- getOption("repos")  
    r["BioCsoft"] <- "https://bioconductor.org/packages/3.7/bioc" 
    r["BioCann"]  <- "https://bioconductor.org/packages/3.7/data/annotation" 
    r["BioCexp"]  <- "https://bioconductor.org/packages/3.7/data/experiment" 
r["BioCworkflows"]<- "https://bioconductor.org/packages/3.7/workflows"            
    r["CRAN"]     <- "https://cran.rstudio.com" 
  options(repos = r)
})
```
回复于 2024-05-12T06:18:47+08:00

部署闪亮的应用程序时出错

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