在Windows下调试（逐行）Rcpp生成的DLL-Java 学习之路

最近我一直在尝试使用Rcpp（内联）来生成DLL，这些DLL在提供的R输入上执行各种任务 . I'd like to be able to debug the code in these DLLs line by line, given a specific set of R inputs. （我在Windows下工作 . ）

为了说明，让我们考虑一个任何人都应该能够运行的具体例子......

下面的代码是一个非常简单的cxx函数，它只是输入向量的两倍 . 但请注意，还有一个额外的变量 myvar ，它会更改值几次，但不能查看调试过程何时正确运行 .

library(inline)
library(Rcpp)

f0 <- cxxfunction(signature(a="numeric"), plugin="Rcpp", body='
    Rcpp::NumericVector xa(a);
    int myvar = 19;
    int na = xa.size();
    myvar = 27;
    Rcpp::NumericVector out1(na);
    for(int i=0; i < na; i++) {
        out1[i] = 2*xa[i];
        myvar++;
    }
    myvar = 101;
    return(Rcpp::List::create( _["out1"] = out1));
')

运行上面的命令之后，输入命令

getLoadedDLLs()

在R会话中显示DLL列表 . 列出的最后一个应该是由上面的过程创建的DLL - 它有一个随机的临时名称，在我的情况下是

file7e61645c

"Filename"列显示cxxfunction已将此DLL放在 tempdir() 的位置，这对我来说当前是

C:/Users/TimP/AppData/Local/Temp/RtmpXuxtpa/file7e61645c.dll

现在，调用DLL的显而易见的方法是通过 f0 ，如下所示

> f0(c(-7,0.7,77))

$out1
[1] -14.0   1.4 154.0

但是我们当然也可以使用 .Call 命令直接通过名称调用DLL：

> .Call("file7e61645c",c(-7,0.7,77))

$out1
[1] -14.0   1.4 154.0

所以我've reached the point where I'm直接使用R输入（这里是向量 c(-7,0.7,77) ）调用一个独立的DLL，并让它正确地将答案返回给R.

What I really need, though, is a facility for line-by-line debugging (using gdb, I presume) that will allow me to observe the value of myvar being set to 19, 27, 28, 29, 30, and finally 101 as the code progresses. 故意设置上面的示例，以便调用DLL不会告诉我们myvar .

为了澄清，这里的“胜利条件”能够观察myvar变化（看到值myvar = 19将是第一步！）而不向代码主体添加任何其他东西 . 这显然可能需要改变编译代码的方式（是否有调试模式设置打开？），或者调用R的方式 - 但我不知道从哪里开始 . 如上所述，所有这些都是基于Windows的 .

最后说明：在我的实验中，我实际上对cxxfunction的副本进行了一些小的修改，以便输出DLL - 以及其中的代码 - 接收用户定义的名称并且位于用户定义的目录中，而不是临时名称和位置 . 但这并不影响问题的本质 . 我提到这只是为了强调如果有人给我轻推，改变编译设置应该相当容易:)

为完整起见，在上面的原始cxxfunction调用中设置verbose = TRUE会将编译参数显示为以下形式：

C:/R/R-2.13.2/bin/i386/R CMD SHLIB file7e61645c.cpp 2> file7e61645c.cpp.err.txt 
g++ -I"C:/R/R-213~1.2/include"    -I"C:/R/R-2.13.2/library/Rcpp/include"      -O2 -Wall  -c file7e61645c.cpp -o file7e61645c.o
g++ -shared -s -static-libgcc -o file7e61645c.dll tmp.def file7e61645c.o C:/R/R-2.13.2/library/Rcpp/lib/i386/libRcpp.a -LC:/R/R-213~1.2/bin/i386 -lR

我的改编版本具有与上述相同的编译参数，除了字符串“file7e61645c”被用户选择的名称（例如“testdll”）和相关文件复制到更永久的位置 .

在此先感谢您的帮助:)

1 回答

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我对Rcpp用户对inline包及其 cxxfunction() 的痴迷感到震惊 . 是的，它确实非常有用，它确实推动了Rcpp的进一步采用，因为它使快速实验变得如此简单 . 是的，它允许我们在源中使用700个单元测试 . 是的，我一直用它来展示这里的例子，在rcpp-devel list或甚至生活在presentations .

但这是否意味着我们应该将它用于每项任务？这是否意味着它没有“成本”，如临时目录中的随机文件名等？ Romain和我在我们的文档中另有说法 .

最后，动态加载的R模块的调试很难实现 . 关于它的（强制性）Writing R Extensions中有一个完整的部分，Doug Bates曾经一两次发布了一个关于如何通过ESS和Emacs这样做的教程（虽然我总是忘记他发布的地方;曾经是_RC39034_上的IIRC） .

Edit 2012-Jul-07:

这是你的一步一步：
- （序言：我已经使用了gcc和g多年，甚至当我添加-g时我并不总是将-O2变成-O0 . 我真的不确定你需要它，但是当你要求它时 . ..）
- 将环境变量CXXFLAGS设置为"-g -O0 -Wall" . 有很多方法可以做到这一点，有些是依赖于平台的（例如Windows控制面板），因此不那么通用和有趣 . 我在Windows和Unix上使用 ~/.R/Makevars . 您可以使用它，或者您可以覆盖R的系统级$ RHOME / etc / Makeconf，或者您可以使用Makeconf.site或...查看完整的文档---但正如我所说， ~/.R/Makevars 是我的首选方式，因为它不干扰R之外的编译 .
- 现在每个编译R通过R CMD SHLIB，R CMD COMPILE，R CMD INSTALL，...将使用 . 因此，使用内联或本地包不再重要 . 继续内联......
- 对于其余部分，我们主要遵循“编写R扩展”中的第4.4.1节“查找动态加载代码中的入口点”：
- 使用R -d gdb启动另一个R会话 .
- 编译代码 . 对于
fun < - cxxfunction（signature（），plugin =“Rcpp”，verbose = TRUE，body ='
int theAnswer = 42;
return wrap（theAnswer）;
“）

我明白了
```
[...]
Compilation argument:
 /usr/lib/R/bin/R CMD SHLIB file11673f928501.cpp 2> file11673f928501.cpp.err.txt 
 ccache g++-4.6 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/usr/local/lib/R/site- library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O0 -Wall -c file11673f928501.cpp -o file11673f928501.o
g++-4.6 -shared -o file11673f928501.so file11673f928501.o -L/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib -lRcpp -Wl,-rpath,/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib -L/usr/lib/R/lib -lR
```
- 调用例如 tempdir() 查看临时目录，cd到上面使用的这个临时目录， dyn.load() 上面构建的文件：
dyn.load（“file11673f928501.so”）
- 现在通过发送中断信号暂停R（在Emacs中，从下拉列表中选择一个简单的选项） .
- 在gdb中，设置断点 . 上面的单个作业对我来说变成了第32行，所以
break file11673f928501.cpp 32
续
- 回到R，调用函数：
有趣（）
- Presto，在我们想要的断点处的调试器中：
R> fun（）

断点1，file11673f928501（），文件11673f928501.cpp：32
32 int theAnswer = 42;
（GDB）
- 现在你可以通过"just"来了解gdb的魔力
现在，正如我在第一次尝试时所说的那样，通过一个简单的包可以更容易（在我看来）， Rcpp.package.skeleton() 可以为你写，因为你不必处理随机目录和文件名 . 但每个人都自己......
回复于 2024-05-04T10:53:53+08:00

在Windows下调试（逐行）Rcpp生成的DLL

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