我的问题是如何使散点图显示过表达和表达不足基因的颜色 . 此时散点图仅显示黑色 . 我想在图上用红色过度表达的基因和低表达的蓝色基因表示 . 我附上了散点图的快照和 . 我需要有关代码的帮助 . 它在R中 . 此代码生成散点图,仅显示黑色的所有内容 .
散点图显示一组与另一组
dataA <- rowMeans(filtered_condensed$E[,7:9])
dataB <- rowMeans(filtered_condensed$E[,10:12])
par(family="mono")
meanX = dataA
meanY= dataB
plot(meanX, meanY, main = "Expression in OPCs vs oligodendrocyte ",
xlab="OPCs log2 expression: group1", ylab="oligodendrocyte log2 expression: group2", cex=0.5, cex.lab= 0.9, title(cex.main=2, font.main=7))
abline(-1, 1, col='purple', lty="dashed")
abline(1, 1, col="purple", lty="dashed")
1 回答
我将在这里添加一些示例数据进行测试:
由于您在不同的截距处有1的斜率,因此您可以通过查看X和Y值之间的差异来轻松计算线上方和下方的斜率 . 然后我在极端值的顶部绘制了彩色点
这产生了以下图表