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在for循环中绘制Plotly图表

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我正在使用plotly转换ggplot2图表并将它们放在knitr html输出中 . 这是报告的工作副本 . http://rpubs.com/kausti/NSEFO-23-Mar-2016第一张图是情节图，而下面的图则不是 . 我希望他们是情节图表，但我被卡住了 .

在下面的代码中，plotChart函数返回一个ggplot2图 . 这段代码有效！

for (tick in tradeOps$ticker)
{
  tmpDF = filter(tradeOps, ticker == tick)
  p = plotChart(tick = tick,Entry = tmpDF$Entry, Target =     tmpDF$Target, SL= tmpDF$SL, TradeType = tmpDF$TradeType, data = wd)
  p = p + annotate("text", x = as.Date(tmpDF$Date)+30, y =   tmpDF$Entry, label = tmpDF$Entry, colour = "blue")
  p = p + annotate("text", x = as.Date(tmpDF$Date)+30, y = tmpDF$Target, label = tmpDF$Target)
  p = p + annotate("text", x = as.Date(tmpDF$Date)+30, y = tmpDF$SL, label = tmpDF$SL)

  print(p)

}

现在，如果我将最后一个print语句更改为 print(ggplotly(p)) ，它就不会在html中打印图表 . 该代码完美地在knitr之外工作 .

此外， print(ggplotly(p)) 在循环外完美运行 . 我错过了什么吗？

EDIT:

包括下面的可重现的例子 . 以下是我的rmd文件 .

---
title: "tmp"
output: html_document
---

```{r, echo=FALSE, message=FALSE, fig.width=8, fig.height=6}
library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
for(i in unique(a$z)){
  s = a[a$z == i,]
  print(ggplot(s,aes(x = x, y = y)) + geom_point())
}



这与显示三个图形的输出html完美配合 . 现在，只需将最后一个print语句更改为 `print(ggplotly(ggplot(s,aes(x = x, y = y)) + geom_point()))` 就会生成一个空白的html而没有任何错误 . 

在终端中运行相同的代码可以很好地工作

```java
library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
for(i in unique(a$z)){
  s = a[a$z == i,]
  print(ggplotly(ggplot(s,aes(x = x, y = y)) + geom_point()))
}

感谢任何帮助 .

谢谢，Kaustubh

r knitr plotly

2 回答

  • 2

    事实证明问题在这里得到解决https://github.com/ropensci/plotly/issues/273

    knitr已知在循环中打印图表图表的问题 . 从这里引用最终答案cpsievert

    ```{r}
l <- htmltools::tagList()
for (i in 1:3) {
  l[[i]] <- as.widget(plot_ly(x = rnorm(10)))
}
l

    
这解决了我的问题 . 虽然在我找到这个解决方案之前，我最终将所有内容从ggplot2移植到plotly R api . 

MLavoie，谢谢你的帮助 . 我创建了一个虚拟数据集，只是为了创建一个可重现的例子 . 虽然您的解决方案可能解决了虚拟示例，但在当前问题中并非与我相关 . 我认为这里提供的解决方案应该是通用的 . 

谢谢，Kaustubh
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  • 5

    我有几个替代方案 . 如果它有用，请告诉我！

    Suggestion1（基础 plotly 使用 subplot ）：

    ```{r, echo=FALSE, message=FALSE, fig.width=8, fig.height=6}
library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
a$id2 <- as.integer(a$z)
p <- plot_ly(a, x = x, y = y, group=z, xaxis = paste0("x", id2), mode = "markers")
p <- subplot(p, nrows=3)
p


    
Suggestion2（使用 `ggplot2` ，但使用 `facet` ）：

```java
```{r, echo=FALSE, message=FALSE, fig.width=8, fig.height=6}
library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
ggplotly(ggplot(a,aes(x = x, y = y)) + geom_point() + facet_grid(z~.))
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