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如何在sparklyr中训练ML模型并在另一个数据帧上预测新值?

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请考虑以下示例

dtrain <- data_frame(text = c("Chinese Beijing Chinese",
                              "Chinese Chinese Shanghai",
                              "Chinese Macao",
                              "Tokyo Japan Chinese"),
                     doc_id = 1:4,
                     class = c(1, 1, 1, 0))

dtrain_spark <- copy_to(sc, dtrain, overwrite = TRUE)

> dtrain_spark
# Source:   table<dtrain> [?? x 3]
# Database: spark_connection
  text                     doc_id class
  <chr>                     <int> <dbl>
1 Chinese Beijing Chinese       1     1
2 Chinese Chinese Shanghai      2     1
3 Chinese Macao                 3     1
4 Tokyo Japan Chinese           4     0

在这里,我有经典的Naive Bayes示例,其中 class 标识属于 China 类别的文档 .

我可以通过执行以下操作在 sparklyr 中运行Naives Bayes分类器:

dtrain_spark %>% 
ft_tokenizer(input.col = "text", output.col = "tokens") %>% 
ft_count_vectorizer(input_col = 'tokens', output_col = 'myvocab') %>% 
  select(myvocab, class) %>%  
  ml_naive_bayes( label_col = "class", 
                  features_col = "myvocab", 
                  prediction_col = "pcol",
                  probability_col = "prcol", 
                  raw_prediction_col = "rpcol",
                  model_type = "multinomial", 
                  smoothing = 0.6, 
                  thresholds = c(0.2, 0.4))

哪个输出:

NaiveBayesModel (Transformer)
<naive_bayes_5e946aec597e> 
 (Parameters -- Column Names)
  features_col: myvocab
  label_col: class
  prediction_col: pcol
  probability_col: prcol
  raw_prediction_col: rpcol
 (Transformer Info)
  num_classes:  int 2 
  num_features:  int 6 
  pi:  num [1:2] -1.179 -0.368 
  theta:  num [1:2, 1:6] -1.417 -0.728 -2.398 -1.981 -2.398 ... 
  thresholds:  num [1:2] 0.2 0.4

但是,我有两个主要问题:

  • 如何在样本中评估此分类器的性能?准确度指标在哪里?

  • 更重要的是,如何使用此训练模型预测新值,例如,在以下 spark 测试数据框中?

测试数据:

dtest <- data_frame(text = c("Chinese Chinese Chinese Tokyo Japan",
                             "random stuff"))

dtest_spark <- copy_to(sc, dtest, overwrite = TRUE)

> dtest_spark
# Source:   table<dtest> [?? x 1]
# Database: spark_connection
  text                               
  <chr>                              
1 Chinese Chinese Chinese Tokyo Japan
2 random stuff

谢谢!

1 回答

  • 6

    如何在样本中评估此分类器的性能?准确度指标在哪里?

    通常(有一些模型提供某种形式的摘要),对训练数据集的评估是Apache Spark中的一个单独步骤 . 这非常适合原生的 Pipeline API .

    Background

    Spark ML Pipelines主要由两种类型的对象构建:

    • Transformers - 提供 transform 方法的对象,它将 DataFrame 映射到更新的 DataFrame .

    您可以 transform 使用 Transformerml_transform 方法 .

    • Estimators - 提供 fit 方法的对象,将 DataFrame 映射到 Transfomer . 按照惯例,相应的 Estimator / Transformer 对称为 Foo / FooModel .

    您可以使用 ml_fit 模型在 sparklyrfit Estimator .

    另外,ML管道可以与 Evaluators (参见 ml_*_evaluatorml_*_eval 方法)结合使用,这些方法可用于根据模型生成的列(通常是概率列或原始预测)计算转换数据的不同度量 .

    您可以使用 ml_evaluate 方法应用 Evaluator .

    相关组件是否包括交叉验证器和列车验证拆分,可用于参数调整 .

    Examples

    5776754 PipelineStages 可以通过直接传递数据,或通过传递 spark_connection 实例并调用上述方法( ml_fitml_transform 等)来急切地评估(如在您自己的代码中) .

    这意味着您可以按如下方式定义 Pipeline

    pipeline <- ml_pipeline(
      ft_tokenizer(sc, input.col = "text", output.col = "tokens"),
      ft_count_vectorizer(sc, input_col = 'tokens', output_col = 'myvocab'),
      ml_naive_bayes(sc, label_col = "class", 
                  features_col = "myvocab", 
                  prediction_col = "pcol",
                  probability_col = "prcol", 
                  raw_prediction_col = "rpcol",
                  model_type = "multinomial", 
                  smoothing = 0.6, 
                  thresholds = c(0.2, 0.4),
                  uid = "nb")
    )
    

    适合 PipelineModel

    model <- ml_fit(pipeline, dtrain_spark)
    

    转换,并应用一个可用的 Evaluators

    ml_transform(model, dtrain_spark) %>% 
      ml_binary_classification_evaluator(
        label_col="class", raw_prediction_col= "rpcol", 
        metric_name = "areaUnderROC")
    
    [1] 1
    

    要么

    evaluator <- ml_multiclass_classification_evaluator(
        sc,
        label_col="class", prediction_col= "pcol", 
        metric_name = "f1")
    
    ml_evaluate(evaluator, ml_transform(model, dtrain_spark))
    
    [1] 1
    

    更重要的是,如何在下面的火花测试数据框中使用这种训练模型来预测新值?

    使用 ml_transformml_predict (后者是一个conince包装器,它在输出上应用进一步的转换):

    ml_transform(model, dtest_spark)
    
    # Source:   table<sparklyr_tmp_cc651477ec7> [?? x 6]
    # Database: spark_connection
      text                                tokens     myvocab   rpcol   prcol   pcol
      <chr>                               <list>     <list>    <list>  <list> <dbl>
    1 Chinese Chinese Chinese Tokyo Japan <list [5]> <dbl [6]> <dbl [… <dbl …     0
    2 random stuff                        <list [2]> <dbl [6]> <dbl [… <dbl …     1
    

    Cross validation

    示例中没有足够的数据,但您可以交叉验证并调整超参数,如下所示:

    # dontrun
    ml_cross_validator(
      dtrain_spark,
      pipeline, 
      list(nb=list(smoothing=list(0.8, 1.0))),  # Note that name matches UID
      evaluator=evaluator)
    

    Notes

    • 请记住,Spark的多项式Naive Bayes实现considers only binary feature (0 or not 0) .

    • 如果您使用带 Vector 列的 Pipelines (不是基于 formula 的调用),我强烈建议您使用标准化(默认)列名:

    • label 为因变量 .

    • features 用于组装的自变量 .

    • rawPredictionpredictionprobability 分别用于原始预测,预测和概率列 .

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