.csv文件中的多行在R中没有相同数量的元素-Java 学习之路

我试图将一个非常大的.csv文件读入R中

OrigTotalPumping <- read.table("/Users/Larry/Desktop/OrigTotalPumping/MasterOrigFt3.csv", 
                               header=F, sep=",")

我收到了一个错误

扫描错误（文件，什么，nmax，sep，dec，quote，skip，nlines，na.strings，：第19437行没有7个元素

所以我试着简单地跳过那一行，但是文件中的多行发生了同样的错误，而且文件太大而无法打开并手动修复 . 例如

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 2 did not have 7 elements

和

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 19439 did not have 7 elements

如何设置它，以便它可以读取此文件，尽管这个问题？

2 回答

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不要跳过它，但最好将此代码置于循环和trycatch块下 . 并对已发布的记录/记录进行错误处理 . 如何在R中执行trycatch：这是same的链接

回复于 2024-04-19T08:42:54+08:00
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你能用这样的 awk 预处理文件来创建一个清理过的文件，其中每行有7个字段吗？
```
awk 'NF==7' original.csv > cleaned.csv
```
或者，如果您的字段分隔符是逗号
```
awk -F',' 'NF==7' original.csv > cleaned.csv
```
或者，基于@Spasdman的想法，您可以使用 awk 向您显示没有7个字段的"unhappy"行
```
awk -F',' 'NF!=7 {print "Line " NR $0}' yourfile.csv | more
```
回复于 2024-04-19T08:42:54+08:00