我正在研究一个由基因,蛋白质和分析组成的生物数据库 . 使用Spring Boot和Thymeleaf,我想 Build 一个Web可视化 . 每个基因都显示在一个页面上,其中包含名称,描述和序列 . 序列由字母A,T,G和C组成 . 我想为那些字母(作品)着色 . 但是,每个字母都写在一个新行中,而不是写入文本,直到行已满(然后到下一行等) . 在gene.html中,我在定义颜色时使用了小标签(之前尝试了p,虽然这是我的问题的原因),但是使用small并没有帮助 .
我希望,我提供的代码片段就足够了(如果没有,请告诉我你需要什么)
gene.html
<!DOCTYPE html>
<html lang="en" xmlns:th="http://thymeleaf.org">
<head>
<title>Gene</title>
<meta http-equiv="Content-Type" content="content/html; charset=UTF-8">
</head>
<body>
<!--import header-->
<header th:include="header"></header>
<div id="main">
<!--GeneID as page heading -->
<h2 th:text="'Gene: '+${identifier}"></h2>
<!--Gene description -->
<p th:text="${description}"></p>
<!-- Sequence -->
<h3 th:text="'Sequence:'"></h3>
<!-- For each char in sequence-->
<th:block th:each="char:${sequence}">
<!--Print the char. Possibility to color encode the bases utilizing switch/case
<small th:text="${char}"></small> -->
<div th:switch="${char}">
<div th:case="'A'">
<small style="color: blue" th:text="${char}"></small>
</div>
<div th:case="'T'">
<small style="color: yellow" th:text="${char}"></small>
</div>
<div th:case="'C'">
<small style="color: forestgreen" th:text="${char}"></small>
</div>
<div th:case="'G'">
<small style="color: red" th:text="${char}"></small>
</div>
</div>
</th:block>
<!--Protein encoded by gene -->
<h3>Protein:</h3>
<a th:href="${'protein?id='+protein}" th:text="${protein}"></a>
</div>
</body>
</html>
GeneController.java
package gui.spring.controller;
import db.sample.Gene;
import db.sample.Protein;
import org.springframework.stereotype.Controller;
import org.springframework.ui.Model;
import org.springframework.web.bind.annotation.RequestMapping;
import org.springframework.web.bind.annotation.RequestMethod;
import org.springframework.web.bind.annotation.RequestParam;
import java.util.Optional;
import static main.Main.query;
/**
* @author Miriam Mueller
* @since 05-12-2018
* @version 1.0
* Class to handle view of one Gene. Gene name, description and sequence are shown. The encoded protein is linked.
*/
@Controller
public class GeneController {
//All calls of localhost:8080/gene get to this controller
@RequestMapping(value = "/gene", method = RequestMethod.GET)
public String einGenAnzeigen(Model model, @RequestParam(value="id") String id) {
model.addAttribute("geneSize",query.getGenes().size());
model.addAttribute("proteinSize",query.getProteins().size());
model.addAttribute("assaySize",query.getAssays().size());
Optional<Gene> gene = query.getGeneByName(id);
if(gene.isPresent()) {
// if gene exists
String description = gene.get().getDesc();
String[] arraySeq = gene.get().getSequence().split("(?!^)");
Protein protein = query.getGeneByName(id).get().getProtein();
model.addAttribute("identifier", gene.get().getIdentifier()); //GenID
model.addAttribute("sequence",arraySeq); //gene sequence
model.addAttribute("description",description); //description
model.addAttribute("protein",protein.getIdentifier()); //encoded protein
}else{
// error messages, if no gene with called id exists
model.addAttribute("gene", "There is no Gene with this ID.");
model.addAttribute("protein","There is no Gene with this ID.Therefore, no reference protein was found.");
model.addAttribute("sequence","");
model.addAttribute("description","");
}
// name of html-template
return "gene";
}
}
谢谢你的时间和精力:)
2 回答
您可以使用
float: left
的样式来使您的div块按照您想要的方式排列 .我比在html中管理它们容易得多 . 然后你可以摆脱那个
th:switch
陈述 .使用以下内容在
resources/static/css/
中创建main.css
文件(作为示例)在您的基因html的
<head>
标记内添加以下内容,以便它可以获取css文件更改您的gene.html以添加类
更换
同
这将在div中添加一个类'基因'和一个带有基因char的类(例如'A') . 然后css具有基因的样式,这些样式对于所有人都是共同的,并且char的样式是特定的(即颜色)
发生的事情是
div
元素是block元素,这意味着它们将垂直堆叠而不是水平堆叠 . 例如,当您遍历序列时:每一个
div
都将以新的一行显示 . 您可以通过将这些div上的display
更改为inline
或inline-block
来将它们显示为内联或使用其默认显示不是
block
的其他元素,例如span
. 删除div's
也可以正常工作,因为small
也是一个内联元素 .