我有一个矩阵,我想分组并最终用于制作情节 . 该数据是群体中每个患者的特定血液标记的计数列表 . 它看起来像这样:
df <- data.frame(MarkerID=c("Class","A123","A124"),
MarkerName=c("","X","Y"),
Patient.1=c(0,1,5),
Patent.2=c(1,2,6),
Patent.3=c(0,3,7),
Patient.4=c(1,4,8))
我想 Build 所有患者(第3-6列)的数据框,其类值为零(第1行),并且所有患者的第二个数据框的类值为1 .
在过去,我使用子集函数根据列中的值选择行,是否可以根据行中的值选择列的子集?
我试过这个:
x <- subset(data, data[1,] == 0)
但是,当我执行 dim(x)
时,列数与 dim(data)
相同,但行数不同 . 有关如何使其返回的任何想法只返回第1行中值为0的列?
罗兰,是的 . 你're example df is what the data frame looks like. There are ~30,000 markers and >400 patients in the data frame so I didn'发表 dput(head(data))
. 感谢重塑提示,我会尝试一下 .
您的示例代码确实可以根据行对列进行子集化
data[,c(TRUE,TRUE,data[1,-(1:2)]==1)]
在数据上我然后能够获得包含所有行的数据框,并且只能获得具有指示类的列 .
1 回答
您的数据也没有很好的安排 . 重塑它会更好 .
如果没有输入数据,这只是一个猜测:
这里
c(TRUE,TRUE,df[1,-(1:2)]==0)
创建一个逻辑向量,前两列为TRUE
,第一行为0 . 然后我根据这个向量对列进行子集化 .这会将您的数据重塑为更常见的格式(对于统计软件):
然后你可以使用
subset
: