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在for循环中跳过错误

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我正在做一个for循环，为我的6000 X 180矩阵生成180个图形（每列1个图形），一些数据不符合我的标准，我得到错误：

"Error in cut.default(x, breaks = bigbreak, include.lowest = T) 
'breaks' are not unique".

我对错误很好，我希望程序继续运行for循环，并给我一个列出了这个错误的列（作为包含列名的变量可能？） .

这是我的命令：

for (v in 2:180){
    mypath=file.path("C:", "file1", (paste("graph",names(mydata[columnname]), ".pdf", sep="-")))
    pdf(file=mypath)
    mytitle = paste("anything")
    myplotfunction(mydata[,columnnumber]) ## this function is defined previously in the program
    dev.off()
}

注意：我发现了很多关于tryCatch的帖子，但没有一个对我有效（或者至少我无法正确应用这个功能） . 帮助文件也不是很有帮助 .

帮助将不胜感激 . 谢谢 .

r for-loop

2 回答

  • 3

    一种（脏）方法是使用带有空函数的 tryCatch 进行错误处理 . 例如，以下代码引发错误并中断循环：

    for (i in 1:10) {
    print(i)
    if (i==7) stop("Urgh, the iphone is in the blender !")
}

[1] 1
[1] 2
[1] 3
[1] 4
[1] 5
[1] 6
[1] 7
Erreur : Urgh, the iphone is in the blender !

    但是你可以将你的指令包装到带有错误处理函数的_1007862中，该函数不执行任何操作，例如：

    for (i in 1:10) {
  tryCatch({
    print(i)
    if (i==7) stop("Urgh, the iphone is in the blender !")
  }, error=function(e){})
}

[1] 1
[1] 2
[1] 3
[1] 4
[1] 5
[1] 6
[1] 7
[1] 8
[1] 9
[1] 10

    但我认为至少应该打印错误消息，以便在让代码继续运行时知道是否发生了错误：

    for (i in 1:10) {
  tryCatch({
    print(i)
    if (i==7) stop("Urgh, the iphone is in the blender !")
  }, error=function(e){cat("ERROR :",conditionMessage(e), "\n")})
}

[1] 1
[1] 2
[1] 3
[1] 4
[1] 5
[1] 6
[1] 7
ERROR : Urgh, the iphone is in the blender ! 
[1] 8
[1] 9
[1] 10

    EDIT : 因此，在您的情况下应用 tryCatch 将是这样的：

    for (v in 2:180){
    tryCatch({
        mypath=file.path("C:", "file1", (paste("graph",names(mydata[columnname]), ".pdf", sep="-")))
        pdf(file=mypath)
        mytitle = paste("anything")
        myplotfunction(mydata[,columnnumber]) ## this function is defined previously in the program
        dev.off()
    }, error=function(e){cat("ERROR :",conditionMessage(e), "\n")})
}
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  • 82

    如果错误发生（例如，如果中断是唯一的），则不可能首先在 myplotfunction() 函数之前或之前进行测试，而只能在不出现错误的情况下绘制它？

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