我用lme4运行一个简单的GLMM ...
model1 <- glmer.nb(S ~ Days*Grazing*Biome + (Days|Site), data=mydata, verbose=T, control=ctrl)
...并从bobyqa:"bobyqa -- maximum number of function evaluations exceeded"进入汇聚代码1 . 所以我查了一下stackoverflow,找到了this有趣的帖子 .
我彻底检查了我的控制对象,现在看起来像这样:
ctrl = glmerControl(optimizer = "bobyqa",
#restart_edge=T,
boundary.tol = 1e-5,
calc.derivs=TRUE,
use.last.params=FALSE,
sparseX = FALSE,
tolPwrss=1e-7,
compDev=TRUE,
nAGQ0initStep=TRUE,
## optimizer args
optCtrl = list(maxfun = 1e5))
但我仍然得到同样的错误 . 然后我跟着另一个link的adivse说道
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您可以使用control = glmerControl(optCtrl = list(maxfun = 1e5))来调整最大功能评估数 . CHECK
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如果@ optinfo $ feval将告诉您实际使用了多少函数评估 . TBD
所以我做了model1 @ optinfo $ feval,它说...... 172
我必须承认我期待别的东西,所以我尝试了从1e3到1e8的所有东西,但我仍然被卡住了 .
我的lme4版本是1.1-10;我使用的是Win10 64bit R3.1.3(也许我应该升级我的R?)
任何(!)帮助或评论都非常感谢!干杯