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在r中使用reprex包创建可重现的示例，其中正在读取本地文件

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我经常使用 reprex::reprex 创建可重复的 R 代码示例，以获取其他人的帮助以消除代码中的错误 . 通常，我使用 iris 或 mtcars 等数据集创建最少的示例，并且效果很好 . 但是，每当我需要使用 own 数据时，我总是无法使用 reprex ，因为问题是如此具体，我不能依赖来自 datasets 库的数据集 .

在这种情况下，我收到以下错误：

# loading needed libraries
library(ggplot2)
library(cowplot)
library(devtools)

# reading the datafile
data <- utils::read.csv(file = "data.csv")
#> Warning in file(file, "rt"): cannot open file 'data.csv': No such file or
#> directory
#> Error in file(file, "rt"): cannot open the connection

由reprex package（v0.2.0）创建于2018-02-19 .

其他地方（How to make a great R reproducible example?）之前有一个很好的讨论 . 作者建议使用像 dput 这样的东西 -

如果您有一些使用这些提示难以构建的数据，那么您始终可以使用例如head（），subset（）或索引来创建原始数据的子集 . 然后用eg . dput（）给我们一些可以立即放入R的东西

但也提到 -

如果您的数据框具有多个级别的因子，则输出输出可能不实用，因为它仍将列出所有可能的因子级别，即使它们不存在于数据子集中 .

所以，如果我想在我的完整数据集中工作，这不是一个好的选择 .

综上所述：

任何人都知道如何创建一个独立的 reprex ，即使它依赖于使用包含 all 数据的本地文件？

r tidyverse reproducible-research reprex

1 回答

  • 1

    缺省情况下，reprex强烈鼓励在会话临时目录中执行 . 但有时候引用特定的本地文件是不可避免的，所以是的，必须有办法做到这一点 .

    要请求在当前工作目录中完成所有工作，请设置 outfile = NA . （更一般地，您可以使用 outfile 参数指定基本文件名和路径 . ）

    如果我提交此reprex，将工作目录设置为我的主目录：

    reprex({
  getwd()
  writeLines(c("V1,V2","a,b"), "precious_data.csv")
  list.files(pattern = "*.csv")
  read.csv("precious_data.csv")
  },
  outfile = NA,
  venue = "so"
)

    我得到这个输出：

    getwd()
#> [1] "/Users/jenny"
writeLines(c("V1,V2","a,b"), "precious_data.csv")
list.files(pattern = "*.csv")
#> [1] "precious_data.csv"
read.csv("precious_data.csv")
#>   V1 V2
#> 1  a  b

    由reprex包创建于2018-09-19（v0.2.1）

    使用 outfile = NA 或 outfile = "path/to/desired/file/base" 是断言对 reprex() 生成的所有文件的位置的控制的一般模式 .

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