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    eval中的错误(expr,envir,enclos):找不到对象'LowSD4temp' -Dplyr&ggplot . 以前工作过

    我是R的新手并且已经查看以下内容以尝试找到解决方案: ggplot2 Error in eval(expr, envir, enclos) : object not found ggplot2 Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'd' not found ggplot call inside a function: Error in...
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    R,ggplot - 自定义我的条形图

    这是我的数据结构: Accession Source Name NucSource Order color Counts Normalized 1 Str1 Our Str1 ch 1 #1C9099 66827 2.318683e-01 2 Str1_plasmid Our Str1 pl 2 #1...
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    R中的不同geom_smooth和lm()估计:忘记将基坡和交互斜率加在一起

    我试图找出为什么我的 lm() 估计值与 geom_smooth 的相同数据和公式不同 . 具体来说,我的分组变量"cat" level 5的斜率在 lm() 输出中> 0,但在geom_smooth中<0,因此该图似乎不反映汇总表 . 这是the data . (比提供行为相似的示例数据更容易 . ) 型号: summary(lm(data=df, y~x*ca...
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    使用树状图和样品标签绘制热图

    使用 made4 的 heatmap 函数,我从示例文件中创建了这个热图树形图: data(khan) heatplot(khan$train[1:30,], lowcol="blue", highcol="red") 如何在热图的边缘为样本添加一组标签,如下图所示? 在这种情况下,标签是与热图第一列和顶行相邻的正方形,用于表示每个样本的标签,以便可以看...
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    在ggplot2中绘制摘要统计信息

    有没有办法在没有原始数据的情况下在ggplot2中绘制汇总统计信息?假设我有三个数据点:第一个具有平均值34.2和标准误差3.4,第二个具有平均值28.6和标准误差0.5,第三个具有平均值44.0和标准误差2.2 . 我该如何策划?
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    绘制不同层中的线 - ggplot2

    我有三个看起来与这些相似的向量,在R中,我想在同一个图上绘制它们 a <- c(3, 6, 16, 17, 11, 21) b <- c(0.3, 2.3, 9, 9, 5 ,12) c <- c(3, 7, 9, 7, 6, 10) 有谁知道我可以使用ggplot2包编写以下命令吗? colours <- rainbow(3) plot(a, col=colours[1...
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    如何在ggplot2的右侧放置转换后的比例?

    我在下面附上了一个简单的例子 . 我想在图的右侧添加一个刻度(刻度线和注释),以英尺为单位显示高程 . 我知道ggplot2不会允许两个不同的比例(见Plot with 2 y axes, one y axis on the left, and another y axis on the right),但因为这是相同比例的转换,有没有办法做到这一点?我更喜欢继续使用ggplot2而不必恢复到plo...
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    ggplot2:绘制同一图中不同的密度

    我还有一个关于ggplot2的问题......但是这一次我甚至不确定我想要做什么......让我们从一个简单的例子开始吧;这是我到目前为止: library(reshape2) library(ggplot2) a.df <- data.frame( id=c('a','b','c','d','e','f','g','h','i','j','k','l','m','n','o','p'...
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    如何使用ggplot2拟合cuminc功能

    有没有人知道一种方法来适应从cmprisk包到ggplot2包的cominc函数? 我收到此错误消息: 不知道如何自动选择cuminc类型对象的比例 . 默认为连续 - 在as.data.frame.default(x [[i]],可选= TRUE,stringsAsFactors = stringsAsFactors)中出错:kan ikke tvinge klasse»“cuminc”«in...
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    如何使用R中的ggplot2并排绘制两个图

    我有从不同方法获得的统计值的小数据帧 . you can download from here.数据集如下所示: 我需要刻面(两个绘图并排使用相同的y轴标签)两个RMSE.SD和MB变量图使用R中的ggplot2包,如下面的示例图所示 . 我编写了这段代码,用于绘制RMSE.SD变量的1个绘图 . library(ggplot2) comparison_korea <- read.cs...
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    ggplot2 - 多个图缩放

    我试图用ggplot2生成多个网格图 . 所以我想生成一个分布图,其中包含x轴下方的附加框图,以及不同组和变量的分布图: CODE: 我尝试使用以下代码执行此操作: library(ggplot2) require(grid) x=rbind(data.frame(D1=rnorm(1000),Name="titi",ID=c(1:1000)), data.fram...
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    与ggplot2并排绘制

    我想使用ggplot2 package并排放置两个图,即相当于 par(mfrow=c(1,2)) . 例如,我希望以下两个图表以相同的比例并排显示 . x <- rnorm(100) eps <- rnorm(100,0,.2) qplot(x,3*x+eps) qplot(x,2*x+eps) 我需要将它们放在相同的data.frame中吗? qplot(displ, hwy,...
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    如何将内存png图像添加到绘图中?

    我有一个png图像,它在内存中自动生成,而不是从磁盘加载 . 我当然可以先将它保存到磁盘但我宁愿不这样做 . 我想在ggplot2图中的某处显示该图像,但找不到合适的包/函数来执行此操作 . 我在记忆中的图像是例如 x <- "data:image/png;base64,..." UPDATE 一个真实的用例,以及我在尝试使用答案#1时得到的错误 library(qre...
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    R:将绘图转换为图像阵列而不保存

    是否有任何方法可以将ggplot图像直接转换为图像数组/矢量(例如CIMG格式)以在卷积神经网络中处理,而无需将这些文件保存在本地磁盘上并重新加载它们? 问题面临: 将每个绘图保存为jpeg文件目前最多需要5个小时 . 我遵循的流程如下: 通过循环生成超过10,000个绘图 使用GGsave将绘图保存为本地磁盘上的png(或jpeg)(循环保存功能) 使用ImageR加载文件(如果使用...
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    在绘图中将点连接到回归线

    考虑ISLR book中的以下数据: Income <- structure(list(X = 1:30, Education = c(10, 10.4013377926421, 10.8428093645485, 11.2441471571906, 11.6454849498328, 12.0869565217391, 12.4882943143813, 12.889632107023...
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    绘制线性和非线性多元回归线的附加变量图

    我想绘制包含线性和非线性关系的多元回归模型的结果 . 我希望每个预测器有一个绘图,条件是其他预测变量 . 这是我的示例数据: library(car) library(broom) library(jtools) ## fit model: model <- lm(mpg ~ poly(disp,3) + wt + carb + factor(gear), data = mtcars)...
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    如何在一个设备中绘制多个LME残差图

    我试图在一个设备中绘制多个诊断LME图,显示标准化残差与拟合值 . 我尝试了通常的par(mfrow = c(2,2))但是用plot(lme)命令绘制LME残差不起作用,因为使用了完整的设备 . 我想使用ggplot2中的facet_wrap或facet_grid,但它不知道如何自动处理模型和绘制残差 . 这是一些测试代码: par(mfrow=c(2,2)) treatment=factor(...
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    如何在ggplot2 qplot上叠加修改过的黄土线?

    背景 现在,我正在创建一个多预测线性模型并生成诊断图来评估回归假设 . (这是我目前喜欢的多元回归分析统计课程:-) 我的教科书(Cohen,Cohen,West和Aiken 2003)建议根据残差绘制每个预测因子,以确保: 残差不系统地与预测变量共同 残差与模型中的每个预测变量相同 在第(2)点,我的教科书有这样的说法: 一些统计软件包允许分析师在残差平均值(0线),高于平均值的...
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    使用ggplot2为绘图添加点

    这是我的数据集中的前9行(54个)和前8个列(1003个中) stream n rates means 1 2 3 4 1 Brooks 3 3.0 0.9629152 0.42707006 1.9353659 1.4333884 1.8566225 2 Siouxon 3 3.0 0.5831929 0....
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    根据回归线的残差距离对一系列变量着色散点图的策略

    我有一个数据框,我想在其中针对第一列迭代地绘制每列 . 我想制作一个sactterplot并根据它们与回归线的距离对点进行着色 . head(data) data nucleosome H3K27me3 H3K9me3 [1,] -20000 4.612515 0.3502755 0.4066719 [2,] -19999 4.619391 0.3500934 0.40...
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    多元线性回归:用置信区间绘制直线

    这是我的问题: 1) 我运行了多元线性回归:假设如下: lm(attitude~quality+price+location+Income) 我主要关心态度和质量之间的关系,其他变量是控制变量 . 2) 然后我想在态度和质量之间做一个散点图 . 这很容易: Q <-ggplot(data=data, aes(x=quality, y=attitude)) Q + geom_point(s...
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    ggplot2:在准时间轴上绘制时间序列和多点预测

    我在绘制时间序列数据和多点预测时遇到问题 . 我想绘制历史数据和一些点预测 . 历史数据应该用一条线连接,另一方面用箭头指向预测,因为第二个预测值实际上是 forecast_02 实际上是修订的 forecast_01 . 使用的库: library(ggplot2) library(plyr) library(dplyr) library(stringr) library(grid) 这是我...
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    如何在ggplot2中绘制两条线

    这似乎是他的ggplot2书中Hadley的一些例子的类似例子,但我似乎无法做到这一点 . 鉴于: off = c(0, 2000, 4000, 6000, 25, 3000, 6050, 9000) tim = c( 0, -100, -200, -300 -25, -125, -225, -325) col = c( 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2) dataf = data.f...
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    R的火山剧情

    我有这行代码: plot(gene_list$logFC, -log10(gene_list$P.Value),xlim=c(-10, 10), ylim=c(0, 15),xlab="log2 fold change", ylab="-log10 p-value") 这导致火山情节;但是我想找到一种方法,我可以用红色点> log(2)和 编辑:好的...
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    在Shiny ggplot中无法控制Legend

    我有两个问题 . 首先,我希望能够格式化图例中的数字 . 在Shiny之外我可以使用geom_point()调用中的格式(val,big.mark =“,”)来做到这一点 . 但是当我到达Shiny时,它将无法工作 . 另外,正如您所看到的,图例中只有两点 . 我想要更多积分 . 如果每个值都可以,但我也希望能够控制它 . 我尝试过scale_fill_manual(values = factor...
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    闪亮应用程序中的qqplot通过条件绘图更改轴和问题

    我有一些问题,将ggplot2应用到闪亮的应用程序中 我无法在下面给出的示例中获得代码 . 出于某种原因,当我使用 aes_string 时,它找不到 factor1 ,当我使用 aes 时,它找不到 params() . 在文件中,使用我的数据,此步骤可行 . 对不起 . 我想使用qqplot2绘制项目的数据 . 当我获取数据并将它们绘制在闪亮的应用程序之外时,一切都很好 . 当我在闪...
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    ggplot2和Shiny:如何用图形大小来缩放图例的大小?

    在ggplot2中,元素的大小是单独指定的 . 当图形的大小发生变化时,元素(例如图例)不会改变 . 当输出ggplot2数字的大小随浏览器窗口而变化时,这可能是Shiny中的问题 . 下面是虚拟Shiny应用程序的代码和不同浏览器窗口大小的两个输出数字 . 较小的数字是丑陋的,因为其传奇的一部分已被切断 . 有没有一种方法可以直接在ggplot2中使用图形大小缩放图例大小,而无需将图形预先保存为...
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    闪亮反应为ggplot2系列名称和图例标签?

    我希望在闪亮的情节中使用Shiny输入作为名称 . 这是我的代码: ggplot() + ... geom_point(data=data.frame(), aes(x=x, y=y, color=paste(input$name)), size = 3) + scale_color_manual(values=c("df1"=&quot...
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    手动设置多层图的图例颜色和文本

    在过去的两年里,我一直在使用r开关,而且最近才开始使用ggplot来构建图形 . 我陷入了下面描述的情况: 我有一个多层图,其中所有数据都在初始ggplot调用中引用的相同数据帧中 . 第1层=点数 第2层=平均趋势 第3层=趋势的衍生物 第4层和第5层=给出平均趋势的点的预测间隔 我想要做的是手动调整图例文本以反映每个图层的名称和颜色/ geom(第4层和第5层可以是一个参考...
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    绘制摘要统计数据

    对于以下数据集, Genre Amount Comedy 10 Drama 30 Comedy 20 Action 20 Comedy 20 Drama 20 我想构建一个ggplot2折线图,其中x轴是 Genre ,y轴是所有量的总和(以 Genre 为条件) . 我尝试过以下方法: p = ggplot(test, aes(factor(Genre), Gross)) ...

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