我是R编程语言的新手 . 我只是想知道有没有办法在我们的数据集中包含 just one column 的空值 . 因为我看到的所有插补命令和库都会归因于整个数据集的空值 .
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以下是使用 Hmisc 包和 impute 的示例
library(Hmisc)
DF <- data.frame(age = c(10, 20, NA, 40), sex = c('male','female'))
# impute with mean value
DF$imputed_age <- with(DF, impute(age, mean))
# impute with random value
DF$imputed_age2 <- with(DF, impute(age, 'random'))
# impute with the media
with(DF, impute(age, median))
# impute with the minimum
with(DF, impute(age, min))
# impute with the maximum
with(DF, impute(age, max))
# and if you are sufficiently foolish
# impute with number 7
with(DF, impute(age, 7))
# impute with letter 'a'
with(DF, impute(age, 'a'))
library(mice)
#get the nhanes dataset
dat <- mice::nhanes
#impute it with mice
imp <- mice(mice::nhanes, m = 3, print=F)
imputed_dataset_1<-complete(imp,1)
head(imputed_dataset_1)
# age bmi hyp chl
# 1 1 22.5 1 118
# 2 2 22.7 1 187
# 3 1 30.1 1 187
# 4 3 24.9 1 186
# 5 1 20.4 1 113
# 6 3 20.4 1 184
#Now, let's see what methods have been used to impute each column
meth<-imp$method
# age bmi hyp chl
#"" "pmm" "pmm" "pmm"
#The age column is complete, so, it won't be imputed
# Columns bmi, hyp and chl are going to be imputed with pmm (predictive mean matching)
#Let's say that we want to impute only the "hyp" column
#So, we set the methods for the bmi and chl column to ""
meth[c(2,4)]<-""
#age bmi hyp chl
#"" "" "pmm" ""
#Let's run the mice imputation again, this time setting the methods parameter to our modified method
imp <- mice(mice::nhanes, m = 3, print=F, method = meth)
partly_imputed_dataset_1 <- complete(imp, 3)
head(partly_imputed_dataset_1)
# age bmi hyp chl
# 1 1 NA 1 NA
# 2 2 22.7 1 187
# 3 1 NA 1 187
# 4 3 NA 2 NA
# 5 1 20.4 1 113
# 6 3 NA 2 184
3 回答
以下是使用
Hmisc
包和impute
的示例有关如何实施插补的详细信息,请查看
?impute
为什么不使用更复杂的插补算法,例如鼠标(链式方程式的多重插补)?下面是R中的代码片段,您可以根据自己的情况进行调整 .
有很多软件包可以帮到你 . (关于数据的更多信息可以帮助建议您最好的选择)
一个例子可以使用 VIM 包 .
它有一个名为 kNN 的函数(k-最近邻插补)这个函数有一个选项 variable ,你可以指定哪些变量应该被估算 .
这是一个例子:
我在本例中使用的睡眠数据集附带了VIM .
如果你的列中存在一些时间依赖性,你想使用时间序列插补包也可能有意义 . 在这种情况下,您可以使用例如 imputeTS 包 . 这是一个例子:
这里使用的tsAirgap数据集也与imputeTS一起出现 .