以下R代码生成一个列表,其中包含从单个目录中读取的50个csv文件的内容 . 每个csv文件都有不同的行数 .
fs <- list.files(my_dir, pattern=".csv$",full.names=TRUE)
l <- lapply(fs, read.csv, stringsAsFactors=FALSE)
当我查看列表时,我需要摆脱一些行,以便我可以将列表转换为单个数据帧 . 有三种“问题”行:
-
在第一个位置以
[[I]]
开头的行,其中I
是整数1:50
,对应于导入的csv文件的序列,501.csv,502.csv等 . -
包含列名的行 . 我尝试在list.files函数中使用row.names = FALSE,但它生成了以下错误:
Error in list.files(my_dir, pattern = ".csv$", full.names = TRUE, row.names = FALSE)
. 我也尝试将skip = 1添加到我的lapply函数中 . 它删除了列名,但创建了一个不同的问题:X附加到行的第一个和最后一个字段的前面,其中包含与每个csv文件关联的第一个观察点 . -
在RStudio控制台中查看时显示为空白的行,至少是肉眼 . 当我尝试将列表转换为数据帧时,我无法判断这些明显空行是否会导致问题 .
下面是str(l)和dput(sapply(l,head,1))的输出 . 我只使用两个部分文件在测试环境中运行它 .
> str(l)
List of 2
$ :'data.frame': 100 obs. of 4 variables:
..$ Date: chr [1:100] "12/31/95" "1/1/96" "1/2/96" "1/3/96" ...
..$ sub1: num [1:100] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
..$ sub2: num [1:100] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
..$ tech: int [1:100] 503 503 503 503 503 503 503 503 503 503 ...
$ :'data.frame': 66 obs. of 4 variables:
..$ Date: chr [1:66] "7/4/98" "7/5/98" "7/6/98" "7/7/98" ...
..$ sub1: num [1:66] NA NA 1.62 NA NA 1.32 NA NA 1.9 NA ...
..$ sub2: num [1:66] NA NA 1.39 NA NA 0.506 NA NA 1.06 NA ...
..$ tech: int [1:66] 504 504 504 504 504 504 504 504 504 504 ...
> dput(sapply(l, head, 1))
structure(list("12/31/95", NA_real_, NA_real_, 503L, "7/4/98",
NA_real_, NA_real_, 504L), .Dim = c(4L, 2L), .Dimnames = list(
c("Date", "sub1", "sub2", "tech"), NULL))
1 回答
R
中没有"right"或"left"名称对齐 . 如果您不想要 Headers ,请在read.csv
调用中使用参数headers=FALSE
.由于缺乏对
read.csv
的熟悉,你的其他问题也会乍一看 . 我建议使用read.csv(file_name, header=FALSE)
读取单个文件并尝试使用其他参数,例如fill
,直到您确信正在读取所需文件内容为止 .