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R使用apcluster绘制日期

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我正在使用包 apcluster 对某些数据进行一些聚类 . 我目前有一个名为 mat 的大型矩阵，它遵循以下格式：

date          A             B            C
1      2000-01-03  2.00000000  0.300000000   4.00000000
2      2000-01-04  0.20000000  0.000030000  -0.02469136
3      2000-01-05 -0.07692308  -0.02469136  -0.07594937

apcluster 提供了绘制原始数据上覆盖的聚类（作为散点图）的功能 . 在绘图我做的时候：

plot(cluster, mat)

不需要担心 cluster ，只有 mat 给我带来了麻烦 . 上面给出了9个图...对角线是列名（日期除外），每个图表示每列的数据与另一列相对 . 这意味着 X 和 Y 轴位于数据范围内，即 . 对于 A ，它将从 -0.08 到 2.0 ！

所以我的问题是我如何绘制每一列的日期，因为在日期将充当 X 轴，而 mat 的数据充当 Y and ，以便所有三列数据将出现在 one 图上，而不修改 plot 命令以上？

apcluster 文档位于HERE .

谢谢 .

r matrix plot cluster-analysis

1 回答

  • 1

    我不是100％确定你需要什么 . 是否要将日期列包含在聚类过程和绘图中？如果在上面提到的数据框架上运行apcluster（），则只会忽略日期列 .

    因此，如果您想要包含日期列，我的建议是将日期列转换为数字，例如通过以下方式：

    x$date <- as.numeric(as.Date(x$date))

    缺点是结果是在几天内（从1970-01-01），因此（1）该列将与其他列完全不同的比例和（2）图的轴将不会被标记为非常可解释的方式 . 因此，最好将日期转换为几年的分数，例如像2013-01-01 = 2013.00; 2013-07-01~ = 2013.50; 2014-01-01 = 2014.00 . 你懂我的意思吗？

    如果您选择这两个选项中的任何一个，apcluster（）将考虑日期，而plot（）命令也会在日期列中绘制A，B，...列 .

    干杯，UBod

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