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glmmadmb错误：超过200的因变量的最大数量

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我需要安装一个具有大约500个固定效果的模型 .

nb.xx.ff <-glmmadmb(count~Pint-1, 
                    data=dnoNM,
                    family="nbinom")

并给出以下错误：

## maximum number of depdendent variables of 200 exceeded 
## use gradient_structure::set_NUM_DEPENDENT_VARIABLES(int i);
## to increase the number of dependent variables
## Error in glmmadmb(count ~ Pint - 1, data = dnoNM, family = "nbinom", zeroInflation = TRUE,  : 
##   The function maximizer failed (couldn't find STD file)
## changed working directory to /spin1/users/swihartbj/projects/_SMFA/Pxs_2015_ctrls_only/Rnw/Final/_ilmn5 
## removed temp directory /scratch/Rtmp/Rtmp4iDtvH/glmmADMB2384f4030d4a1

有没有办法从 R 电话中增加这个？

r

1 回答

  • 1

    是 .

    按照建议here将"-ndv 3000"添加到 extra.args . 只要固定效果的数量是唯一的问题，并且列出的数字（本例中为3000）大于固定效果的数量，这应该有效：

    nb.xx.ff <-glmmadmb(count~Pint-1, 
                    data=dnoNM,
                    family="nbinom",
                    extra.args="-ndv 3000")
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