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如何在R中使用“ComplexHeatmap”包在行注释中添加ID变量？

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我创建了一个基本的热图，其中列对应于时间点，每行代表一个人 . 在我的数据集中，我有一个ID变量，我希望它显示在行注释中，以便我可以清楚地看到热图中哪些行与哪个行相对应 . 看看下面的图片 .

enter image description here

我只想在树形图和热图之间的左边显示个别ID .

到目前为止，我已经使用我的CSV文件创建了一个矩阵

mymatrix<-as.matrix(mydata[ ,c(2:9)]

并运行热图功能，同时强制它仅在行上集群

Heatmap(mymatrix,cluster_columns = FALSE)

此外，我想创建一个单独的列，显示在热图的右侧，代表个人的收入但不影响群集 . 深色代表收入丰厚，色彩浅的个人，收入微薄 .

感谢您提供的任何帮助！

r heatmap hierarchical-clustering

1 回答

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    假设您的"id"编码为 id ，"revenue"编码为 revenue . 两者都是载体 . 您可以按如下方式制作热图：

    revenue_col = c("large" = "black", "weak" = "grey")
library(ComplexHeatmap)
ht_list = rowAnnotation(id = row_anno_text(id, just = "right"), 
        width = max_text_width(id)) + 
    Heatmap(mymatrix, name = "mymatrix", cluster_columns = FALSE) + 
    Heatmap(revenue, col = revenue_col, width = unit(5, "mm")
ht_list

    将树状图放在最左边：

    draw(ht_list, row_dend_side = "left")
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