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一列的子集因子

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我有数据集（b.data），其中包含调查中记录的海洋物种信息 . 每行与下面的列 Headers 的单个动物有关：

“Area”“Year”“Cruise”“Vessel”“Haul”“Haul_ID”“Common_name”“Scientific_Name”“Length_mm”“Sex”“Width”

我想将数据子集化为仅包括某些物种进行分析 . 我写了下面的代码，命名我要包括的物种（31种）

species.list <- c("Blonde ray","Brown crab","Cod","Common dab", ... etc

我不知道如何编写代码然后从整个数据集中对这些行进行子集化 . 我已经尝试了下面的代码，但它返回0观察 .

z=b.data[rownames(b.data$Common_name) %in% species.list,]
r

2 回答

  • 1

    你只需要摆脱 row.names() . 考虑：

    b.data <- data.frame(Common_name=c("Blonde ray","Brown crab","Cod",
                                   "Common dab", LETTERS[1:7]), 
                     x=rnorm(11))
b.data
#    Common_name          x
# 1   Blonde ray  0.3631655
# 2   Brown crab -0.6668250
# 3          Cod -0.2829071
# 4   Common dab  0.3893549
# 5            A  0.7206768
# 6            B -0.9790288
# 7            C -0.5366370
# 8            D  1.9940040
# 9            E  1.2800009
# 10           F -0.2024495
# 11           G -2.1230087

    这是 row.names() 返回的内容：

    row.names(b.data)
# [1] "1"  "2"  "3"  "4"  "5"  "6"  "7"  "8"  "9"  "10" "11"
row.names(b.data$Common_name)
#

    对于 b.data ，它是行号，因为我没有分配任何行名，而 b.data$Common_name 只是数据框中的变量，它根本没有任何行名 . 如果你离开 row.names() ，这就是你得到的：

    species.list <- c("Blonde ray","Brown crab","Cod","Common dab")
z = b.data[b.data$Common_name %in% species.list,]
z
#   Common_name          x
# 1  Blonde ray  0.3631655
# 2  Brown crab -0.6668250
# 3         Cod -0.2829071
# 4  Common dab  0.3893549
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  • 2

    几乎在那里我想 - 怎么样

    z=b.data[b.data$Common_name %in% species.list,]
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