我正在使用igraph做一些网络分析 . 作为其中的一部分，我必须创建一个矩阵，其中包含2列和链接的行数 . 我有一个大型网络（数百万个链接）并且在运行3小时后创建此矩阵不起作用（没有错误，没有结果，并且显示“没有响应”） .
这种字符矩阵的最大大小是多少？运行需要多长时间？
我在运行速度为2.67 Ghz的4 GB内存的Windows 7计算机上运行64位R 2.14.1
谢谢
添加感谢您的快速回复 . 这让我觉得它不是矩阵的大小;事实证明，我正在使用另一个矩阵的列来创建该矩阵 .
R中向量的理论极限是2147483647个元素 . 所以这大约是10亿行/ 2列 .
...但是这些数据量不适合4 GB的内存......尤其是字符向量中没有字符串 . 每个字符串至少为96个字节（ object.size('a') == 96 ），矩阵中的每个元素都是这样一个字符串的指针（8个字节）（尽管每个唯一字符串只有一个实例） .
object.size('a') == 96
所以通常发生的事情是机器开始使用虚拟内存并开始交换 . 重型交换通常会杀死本世纪所有希望 - 特别是在Windows上 .
但是如果你正在使用一个包（igraph？）并且你要求它生成矩阵，它可能会做很多内部工作并创建许多辅助对象 . 因此，即使您没有接近单个结果矩阵的内存限制，用于生成它的算法也会耗尽内存 . 它也可能是非线性的（二次或更差），这将再次扼杀本世纪永远完成的所有希望......
一个好的研究方法可能是将它计时在一个小图上（例如使用 system.time ），再次将图形大小加倍几次 . 然后你可以看到时间是线性的还是二次的，你可以估计完成大图所需的时间 . 如果预测说一周，那么你知道;-)
system.time
R矩阵可以用单索引表示法进行寻址，因为它们实际上是具有长度为2的dim属性的向量，并且即使您使用的是64位版本，R向量也会通过带符号的32位整数进行寻址 . 因此，2列矩阵最多可以有 2^30-1 行 .
2^30-1
data.frame 允许您使用 2^31-1 行和列 .
data.frame
2^31-1
2 回答
R中向量的理论极限是2147483647个元素 . 所以这大约是10亿行/ 2列 .
...但是这些数据量不适合4 GB的内存......尤其是字符向量中没有字符串 . 每个字符串至少为96个字节（
object.size('a') == 96），矩阵中的每个元素都是这样一个字符串的指针（8个字节）（尽管每个唯一字符串只有一个实例） .所以通常发生的事情是机器开始使用虚拟内存并开始交换 . 重型交换通常会杀死本世纪所有希望 - 特别是在Windows上 .
但是如果你正在使用一个包（igraph？）并且你要求它生成矩阵，它可能会做很多内部工作并创建许多辅助对象 . 因此，即使您没有接近单个结果矩阵的内存限制，用于生成它的算法也会耗尽内存 . 它也可能是非线性的（二次或更差），这将再次扼杀本世纪永远完成的所有希望......
一个好的研究方法可能是将它计时在一个小图上（例如使用
system.time），再次将图形大小加倍几次 . 然后你可以看到时间是线性的还是二次的，你可以估计完成大图所需的时间 . 如果预测说一周，那么你知道;-)R矩阵可以用单索引表示法进行寻址，因为它们实际上是具有长度为2的dim属性的向量，并且即使您使用的是64位版本，R向量也会通过带符号的32位整数进行寻址 . 因此，2列矩阵最多可以有
2^30-1行 .data.frame允许您使用2^31-1行和列 .