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使用Renjin将POJO对象的ArrayList转换为R数据帧

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我正在尝试使用Renjin从Java程序中存在的数据构建模型 . 我有一个 ArrayList POJO对象列表,其中每个属性都是 Stringdoubleint . 如果我调用 toString() ,记录看起来像这样:

Record{id='uibbd923e5929b43', countryCode='FR', revenue=3.14159, count=1}
Record{id='uicdd967e5942b55', countryCode='GB', revenue=0.07, count=49}
...

我实例化了R,在JVM中运行,如下所示:

ScriptEngineManager manager = new ScriptEngineManager();
ScriptEngine engine = manager.getEngineByName("Renjin");

...并将 ArrayList 条记录放入R:

engine.put("records", records);

在R内部,记录存储为 <externalptr> 对象的列表 . 可以看到存储在指针内的值的字符串表示,例如,

engine.eval("print(data.frame(lapply(records, as.character), stringsAsFactors=FALSE))");

但是,我真的希望这些存储为具有正确数据类型的数据帧,而不是可以被视为字符串的外部指针列表 .

如何将 externalptr 的列表转换为数据帧?

更新:

这是我蹩脚的解决方法,至少现在是这样 . 将数据写入CSV:

CSVWriter writer = new CSVWriter(new FileWriter("tmp/output.csv"), '\t');    
writer.writeNext(new String[] {"id", "countryCode", "revenue", "count"});

    for (Record record : records){

        writer.writeNext(new String[]{record.getId(),
                record.getCountryCode(),
                record.getRevenue().toString(),
                record.getCount().toString()});
    }

    writer.close();

然后Renjin将CSV读入数据帧:

engine.eval("df <- read.table(\"tmp/output.csv\", header = TRUE)");

更新:

目前,我决定使用Rserve,因为它提供了更多的灵活性 . Rserve(vs Renjin)的一个缺点是我们现在需要确保R正在运行并安装了必要的软件包 .

1 回答

  • 2

    这可以作为一个小帮助库组合在一起,但是目前,您可以通过以下方式在Java中“手动”构建一个data.frame:

    StringArrayVector.Builder id = new StringArrayVector.Builder();
    StringArrayVector.Builder country = new StringArrayVector.Builder(); 
    DoubleArrayVector.Builder revenue = new DoubleArrayVector.Builder();
    for(Record record : records) {
       id.add(record.getId());
       country.add(record.getCountry());
       revenue.add(record.getRevenue());
    }
    
    ListVector.NamedBuilder myDf = new ListVector.NamedBuilder();
    myDf.setAttribute(Symbols.CLASS, StringVector.valueOf("data.frame"));
    myDf.setAttribute(Symbols.ROW_NAMES, new RowNamesVector(records.size()); 
    myDf.add("id", id.build());
    myDf.add("country", country.build());
    myDf.add("revenue", revenue.build());
    

    从上面可以看到,data.frame对象实际上只是一个列的列表,因此需要花费一点时间才能将一堆Java Bean(基本上是基于行的格式)添加到一组列中 .

    添加“row.names”属性也很重要,该属性由nrow()等函数使用以获取data.frame对象的维度 .

    上面的RowNamesVector是StringVector的一个专门实现,它根据需要计算row.names“1”,“2”,“3”等,而不为所有字符串分配内存 .

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