我正在提出我之前提出的两个问题：
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Put figure directly into Knitr document (without saving file of it in folder)
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Put figure directly into Knitr document (without saving file of it in folder) Part 2
我正在编写一个R包，为输出数据汇总的用户生成.pdf文件 . 我在包中有一个.Rnw脚本（这里，我的MWE称为test.Rnw） . 用户可以这样做：
knit2pdf("test.Rnw", clean=T)
这使得这个过程变得简单，因为它会自动从.tex文件创建.pdf文件，并为它们删除不必要的文件（例如.aux和.log） . 它还将任何图像存储到临时目录中（使用tempdir（）），然后系统将这些图像合并到.tex和.pdf文件中后，将由系统定期擦除 . 这意味着他们也不必擦除图像文件 .
以下是我的测试.RWW MWE：
\documentclass[nohyper]{tufte-handout}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{longtable}
\setcaptionfont{% changes caption font characteristics
\normalfont\footnotesize
\color{black}% <-- set color here
}
\begin{document}
<<setup, echo=FALSE>>=
library(knitr)
library(xtable)
library(ggplot2)
# Specify directory for figure output in a temporary directory
temppath <- tempdir()
opts_chunk$set(fig.path = temppath)
@
<<diamondData, echo=FALSE, fig.env = "marginfigure", out.width="0.95\\linewidth", fig.cap = "The diamond dataset has varibles depth and price.",fig.lp="mar:">>=
print(qplot(depth,price,data=diamonds))
@
<<echo=FALSE,results='asis'>>=
myDF <- data.frame(a = rnorm(1:10), b = letters[1:10])
print(xtable(myDF, caption= 'This data frame shows ten random variables from the distribution and a corresponding letter', label='tab:dataFrame'), floating = FALSE, tabular.environment = "longtable", include.rownames=FALSE)
@
Figure \ref{mar:diamondData} shows the diamonds data set, with the
variables price and depth.Table \ref{tab:dataFrame} shows letters a through j
corresponding to a random variable from a normal distribution.
\end{document}
我应该注意到，实际上，我的包中还有另一个.Rnw文件，通过以下方式调用test.Rnw文件：
knit2pdf("/inst/Rnw/test.Rnw","/path/test.tex",clean=T)
在任何情况下，我都试图让这个包准备好提交给CRAN并遇到两个问题：
1）首先是更令人困惑的问题：上面的MWE代码似乎适用于Mac系统，但似乎不适用于Windows系统！在Windows上，生成的.pdf文件不包含图像 . 经过故障排除后，我想我已经找到了问题，但仍然无法找到解决方案 .
基本上，在Windows上，似乎tempdir（）命令将创建一个带有双反斜杠的路径，例如\ this \是\ myPath . 然后，在.tex文件中，到临时目录（包含图像）的路径是单反斜杠，例如\ this \是\ myPath . 但是，这些应该是单正斜杠，例如/ this / is / myPath，以便.tex文件找到存储在临时目录中的图像 .
实际上，如果我手动将反斜杠更改为Windows中的.tex文件中的正斜杠，那么我可以将其成功转换为成功包含图像的.pdf文件 .
但是，我不确定如何在我的语法中解决这个问题 . 我认为这将是一个简单的解决方案，但如果我只是做一些像：
# Specify directory for figure output in a temporary directory
temppath <- tempdir()
gsub("\\\\", "/", temppath)
然后，即使.tex文件包含所需的正确单个正斜杠，也无法将图像存储在Windows上的临时目录中 . （我相信）相同的变量用于表示临时目录位置，以及.tex文件中的图像位置，并且它们必须具有不同的斜杠方向 .
我有点意外，早些时候没有出现过（至少在我的研究中） . 也许人们在运行knitr时没有自动图像擦除？
2）我想知道在我的另一个.Rnw文件中，我是否可以接受第二行调用：
knit2pdf("/inst/Rnw/test.Rnw","/path/test.tex",clean=T)
system(sprintf("%s", paste0("rm -r ", "/path/myFile.tex")))
这样.tex文件也可以自动删除 . 我试图确认CRAN标准可以接受这样的语法，因为它确实涉及从用户的计算机中删除文件（看起来像危险/恶意软件），尽管它专门指向它刚刚生成的.tex文件，并且所以它不应该删除对他们重要的东西 .
*注意：我默认删除所有中间文件，因此用户只处理.pdf文件 . 但是，我仍然允许用户选择违反此默认值，并在需要时保留这些中间文件 .
1 回答
你提供的代码给我一个关于特定于Sweave的表达式的编织警告：
\SweaveOpts{concordance=TRUE}如果我删除它，页面为我编译（有很多盒子错误）并在Windows（和Ubuntu）中生成带有图形的PDF .我'm also not clear why you want to specify your own temporary directory in the first place: doesn' t
knitr为你照顾这个？我刚刚安装了MikTex并对其进行了更新（许多软件包在安装后立即使用4或5年） .
我试过R-devel和R-3.2.2：