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knitr在HTML风格的注释中执行R代码块

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使用 Rstudio 编辑 Rmarkdown 文件，我使用HTML注释标记出我不想处理的大块或在输出中 . 这在Rstudio中运行得很好，它忽略了注释中的所有内容 . 但是，当我要求Rstudio编织文档时， knitr 正在评论中执行 R 代码块 .

这是一个MWE .Rmd文件：

# Important stuff I want to see
This is what I want to see:
```{r}
pi # I like pi
<!--- **This section commented out, as not ready to be knit yet** This is what I do not want to see: ```{r} cake # I also like cake, but it's undefined ``` --> 

这导致编织器失败 `Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'cake' not found ... Execution halted` 

有没有一种简单的方法可以注释掉整个Rmarkdown文件，这会阻止knitr在评论中执行R代码块？

我查看了[global comment option for R markdown in knitr](https://stackoverflow.com/q/11190281/5568465)和[Comments in Markdown](https://stackoverflow.com/q/4823468/5568465)，以及[https://yihui.name/knitr/](https://yihui.name/knitr/)，但没有找到解决方案 .
r rstudio knitr r-markdown

3 回答

  • 0

    选择 {r} 代码块之前和之后的行，并使用Control / Shift-C（pc）注释掉 . 你会得到这种语法;它赢了't knit, and won' t给出错误 .

    <!-- **This section commented out, as not ready to be knit yet** -->
<!-- This is what I do not want to see: -->
<!-- ```{r} -->
<!-- cake # I also like cake, but it's undefined -->
<!-- ``` -->
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  • 0

    考虑到jburkhardt使用 eval=F 的想法，这可以作为一种方法来执行块注释，其中knitr不执行R代码块：

    Stuff I want to see...
```{r}
pi
    <!-- This is added at the beginning of the comment: ```{r, include=FALSE} knitr::opts_chunk$set(eval= FALSE) ``` Stuff I have commented out: ```{r} cake ``` This is added to the end of the comment: ```{r, include=FALSE, eval=TRUE} knitr::opts_chunk$set(eval= TRUE) ``` -->

    More stuff I want to see:

    2*pi

    
它当然不是防弹的（例如，knitr仍将运行它使用显式 `eval=true` 找到的任何代码块），但它适用于我的情况 .
    回复于
  • 1

    在第二个代码垃圾中，您可以设置 eval=F ，直到完成这部分代码 .

    <!--
**This section commented out, as not ready to be knit yet**
This is what I do not want to see:
```{r eval=F}
cake # I also like cake, but it's undefined

    -->

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