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使用随机森林模型提高预测新数据的速度
我正在使用随机森林生成物种分布模型 . 这些模型试图以各种环境属性为条件来预测物种发生的概率 . 对于大多数物种,我们的初始潜在预测因子集合介于10到25之间,每个预测变量都由具有460,000,000个单元格的GIS光栅文件表示 . 由于训练数据的性质,我不会在这里讨论,我实际上是基于数据的子集构建多个RF模型(大约10到100),然后组合以创建每个物种的整体模型 . 实际上构建模型花费的时间相... -
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在R中安装光栅程序包时出现编译错误(Linux 18.04)
我在互联网上查找一些解决方案后尝试安装构建必备工具,但仍然收到此错误消息: free(): invalid pointer Aborted (core dumped) ERROR: loading failed * removing ‘/home/manvi/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/raster’ Warning in install.packages ... -
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R - 'raster'包 - RasterLayer(“raster”)不提取到SpatialPolygonsDataFrame(“sp”);只需返回NULL对象
使用 raster 包,我读入了两个数据集,一个ASCII栅格和一个ESRI shapefile . 我想将光栅的(水温)数据提取到shapefile的全部范围,shapefile是一个湖岸线 . 使用 shapefile() 函数读入时,ESRI shapefile被视为 SpatialPolygonsDataFrame . shapefile <- shapefile("sh... -
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计算R中大量栅格和空间对象的地理空间统计数据
我正在尝试计算R中空间对象的气候变量的平均值 . 挑战在于我正在尝试为世界上每个二级行政区域(www.gadm.org)计算这些方法,我需要一个有效的计算统计数据的方法 . 我已经计算了这些统计数据,对于跨越较少气候区/瓦片的较小区域定义没有问题,但是当试图将这项任务扩展到整个世界时,后勤问题已成为障碍 . 我尝试过将gadm.org的2级边界shapefile用于整个世界,然后导入并合并worl... -
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从多个数据集R中提取坐标
我发现使用从shapefile获得的特定地理区域从具有经度和纬度坐标的多个数据帧中提取栅格值的问题 . 所有地理区域都有不同的程度,并且具有相应的坐标数据出现数据框 . 我尝试使用raster包中的mask功能: 首先 - 将shapefile,栅格图层和数据框作为列表加载 shp<-list.files(pattern = "shp") shape<-lapply... -
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错误:使用栅格属性表(RAT)时,新数据中的预测变量与训练数据中的预测变量不匹配
我有一个使用包含数字和分类预测变量的插入符包训练的RandomForest模型 . 我试图使用这个训练的模型对新数据集进行预测,该数据集是一个rasterStack,每个预测器包含一个图层 . 我已经使用 raster 包中的 ratify 函数将分类栅格图层转换为因子,并通过添加栅格属性表(RAT)添加了与训练集语法对应的字符串,但是当我预测我得到以下内容时错误: # Error in pred...