我注意到,当使用包含因子类型预测变量的 lme4
包中的 lmer
函数指定模型时,指示预测变量级别的后缀是该因子级别的字符串,如下处理的情况:
library(afex)
data(obk.long)
m1 <- lmer(value ~ treatment + (1|id), obk.long)
summary(m1)
Fixed effects:
Estimate Std. Error t value
(Intercept) 4.200 0.654 6.43
treatmentA 2.050 0.980 2.09
treatmentB 1.800 0.856 2.10
但是,在 afex
包中使用 mixed
函数时,后缀为数字:
m2 <- mixed(value ~ treatment + (1|id), obk.long)
summary(m2$full.model) # this should be the same as the lmer output... it's er, not
Fixed effects:
Estimate Std. Error t value
(Intercept) 5.483 0.375 14.62
treatment1 -1.283 0.532 -2.41
treatment2 0.767 0.565 1.36
有谁知道导致预测标签级别后缀和/或固定效果差异的原因是什么?
1 回答
afex
默认情况下将分类预测变量的对比度编码设置为总和对比(当您使用mixed
时在消息中提及),而lmer
调用中指定的模型使用R的全局选项中的对比度设置 .