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做了很多相关性测试

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我有这样的15个数字列（值是随机的，不是我的真实数据）：

Val(numeric):      val.2:              Val.3   ....   Val.15  
1.698              1.689               5.478           5.68
4.98               0.65                69.47           4.78
0.123              3                   12 .698         6.98
-----------------------------------------------------------
0.047              65.98               123.47          1.547

我计算了每个变量之间的相关性：

val      val.2  ...  val.15                  
val       1        0.32         0.1256                  
val.2     0.9      1            0.125    
...
val.15    0.36    0.12          1

但我想在每列之间进行相关性测试（cor.test（）） . 有没有办法自动完成，而不是做很多测试，如：
cor.test（df $ val，df $ val.2，method = 'spearman'）
cor.test（df $ val，df $ val.3，method = 'spearman'）
......等
cor.test（df $ val.14，df $ val.15，method = 'spearman'）

r testing correlation

2 回答

  • 1

    你可以试试

    library(Hmisc)
rcorr(as.matrix(df), type='spearman')$P
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  • 0

    只要你想在所有对（或其他组合）上做某事， combn 函数就是一种方法 . 它将创建对，并可选择在每对上运行一个函数：

    > combn(1:4, 2, FUN=function(x) cor.test(iris[,x[1]], iris[,x[2]])$p.value)
[1] 1.518983e-01 0.000000e+00 0.000000e+00
[4] 4.513314e-08 4.073229e-06 0.000000e+00
> p.adjust(.Last.value)
[1] 1.518983e-01 0.000000e+00 0.000000e+00
[4] 1.353994e-07 8.146457e-06 0.000000e+00
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