我正在尝试构建一个气泡图，其中一个因子具有实心填充，另一个因素基于对数倍数变化填充 . 我有一个差异丰富的蛋白质列表，两个时间点之间的对数倍数变化值（我想要填充的两个因素不同） . 我可以根据日志折叠变化（第一个图）和基于时间（第二个图）来填充气泡，但我真的希望所有的2 am气泡都是黑色/灰色，并且所有8 pm气泡都要填充条件记录倍数变化 . 可以在不制作2个图表的情况下完成吗？
我正在使用包ggplot2和ggthemes在R v 3.3.2中工作 .
时间= 2个时间点ETS.category =基本上将单个蛋白质分组的蛋白质功能类别sumnsaf =每个蛋白质在每个时间点的蛋白质丰度值（气泡大小的比例）
我无法提供输出输出，因为它对于一个帖子来说太大了，但希望你能从第一行得到这个想法（我可以提供输入文件，如果需要的话）：
Protein Entry Protein.names LogFoldChange ETS.category Time
1 01554_comp1507_c0 Q9BLZ1 Luciferase -1.581 bioluminescence 8:00 PM
2 01330_comp1408_c1 Q9BLZ1 Luciferase -1.406 bioluminescence 8:00 PM
3 23772_comp16505_c1 Q9BLZ1 Luciferase -1.355 bioluminescence 8:00 PM
4 01339_comp1414_c0 Q9BLZ1 Luciferase -1.160 bioluminescence 8:00 PM
5 01279_comp1377_c0 Q9BLZ1 Luciferase -1.093 bioluminescence 8:00 PM
6 01252_comp1362_c0 Q9BLZ1 Luciferase -0.992 bioluminescence 8:00 PM
xiphias1 xiphias2 xiphias3 xiphias4 xiphias5 xiphias6 sumnsaf
1 89.32287 138.36007 113.07703 100.67700 89.621533 55.3685 586.4270
2 360.74747 368.67670 369.56857 339.59370 188.797933 177.9319 1805.3163
3 121.36577 140.46653 140.11740 104.01390 32.485567 0.0000 538.4492
4 0.00000 0.00000 0.00000 15.78833 71.783467 0.0000 87.5718
5 45.70467 0.00000 76.76587 57.41630 9.734833 0.0000 189.6217
6 97.30740 98.25493 130.76463 132.09267 108.591567 0.0000 567.0112
对于基于对数倍数变化的填充：
ggplot(prot.sum2) + geom_jitter(aes(x=Time, y=ETS.category, colour=LogFoldChange, size=sumnsaf), alpha=0.5, width=0.2, height=0.2) + labs(y='Protein Category') + geom_hline(yintercept=c(1.5, 2.5, 3.5, 4.5, 5.5, 6.5, 7.5, 8.5, 9.5, 10.5, 11.5, 12.5, 13.5, 14.5, 15.5, 16.5, 17.5, 18.5, 19.5, 20.5, 21.5, 22.5, 23.5), color='grey80') + theme_tufte()
根据时间填写
ggplot(prot.sum2) + geom_jitter(aes(x=Time, y=ETS.category, size=sumnsaf, colour=factor(Time)), alpha=0.5, width=0.2, height=.2) + labs(y='Protein Category') + geom_hline(yintercept=c(1.5, 2.5, 3.5, 4.5, 5.5, 6.5, 7.5, 8.5, 9.5, 10.5, 11.5, 12.5, 13.5, 14.5, 15.5, 16.5, 17.5, 18.5, 19.5, 20.5, 21.5, 22.5, 23.5), color='grey80') + guides(size=guide_legend(title='Abundance')) + scale_colour_manual(values=c('black', 'red')) + guides(colour=F) + theme_tufte()
