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drc包中的剂量 - 反应曲线图未显示所有点
我使用drc包用13点绘制剂量反应曲线 . 但是，使用下面的数据时，图中只能看到13个点中的6个 . 有没有人有这个问题的解决方案？我怀疑重复的X值是问题的一部分 - 模型的平均值是重复吗？ library(drc) x<-c(0.001,0.001,0.01,0.01,0.1,0.1,1,1,10,10,0,0,0) y<-c(15,10,19,11,10,5,13,4,0,0,10... -
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如何绘制模型drc包？
脚本： lettuce m0<-drm(weight~conc, data = lettuce, fct = LL.3()) summary(m0) modelFit(m0) plot(m0) 我想知道如何在轴 x 中绘制 conc 的确切值及其在 y 中的对应值以及如何绘制（ r² ） . -
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drc :: drc用ggplot2绘图
我正在尝试使用 ggplot2 重现 drc 图 . 这是我的第一次尝试（MWE如下） . 但是，我的ggplot2与基础R图有点不同 . 我想知道我在这里遗失了什么？ library(drc) chickweed.m1 <- drm(count~start+end, data = chickweed, fct = LL.3(), type = "event") plo... -
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drc：使用交互术语时drm出错
我想为 drc R 包中的以下数据拟合 log-logistic 回归，以获得Temp和Variety的组合 . 但是，我的代码抛出以下错误 Error in Temp:Variety : NA/NaN argument 码： df2 <- structure(list(Temp = c(15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 2... -
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用ggplot2重现drc :: plot.drc
我想用 ggplot2 重现以下 drc::plot.drc 图形 . df1 <- structure(list(TempV = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L... -
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奇怪的ED50与drc
我试图用 drc 包估算IC50值 . 绘制模型的工作正常 . 但是当我使用 ED 时，我得到了不合理的结果 . 根据我的理解，IC50应该在模型的拐点附近 . 在这种情况下，我估计大约0.25 . 但 ED 将其计算为-1.43 . 我是否使用_747761错误或错过了什么？ 谢谢 数据的小例子： # Create Data Conc <- c(0.03125, 0.06250, 0.1... -
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使用R中的drc包回归多个剂量 - 反应曲线
我试图通过我的实验数据拟合回归（4或5 PL） . 我有几种化合物抑制我感兴趣的酶 . 每个都有自己的0-100％酶活性范围 . 所有数据都在一个数据框中，并由一列指定我的化合物（'毒素'）进行dinstinguished . 因此，我希望单独对每种毒素/化合物进行回归 . 我尝试了以下代码 drc <- drm(avg ~ conc, data = testdata, toxin, fct... -
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插值与绘制曲线不对齐（drc包）
我试图确定蛋白质的量（TIMP）对od（光密度）与TIMP的四参数曲线 . 这里的问题在于，当我将插值绘制在它们从（图像）得到的相同标准曲线的顶部时，它们不对齐 . Misalligned interpolations-curve有任何建议吗？ 谢谢 . ##STANDARDS## standards <- structure(list(con = c(0, 0, 0.156, 0.156... -
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mselect函数的drc包在函数内部不起作用
我想使用drc包中的mselec函数来选择剂量反应数据集的最佳模型 . 但是，如果在函数内部使用mselect，则mselect不起作用 . 以下代码有效： library(drc) ryegrass.m1 <- drm(rootl~conc, data = ryegrass, fct = LL.4()) mselect(ryegrass.m1,list(LL.5(), LN.4(), W... -
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什么是drc包中的pmodels
对不起，如果这是一个愚蠢的问题，但我无法弄清楚如何在drc包中使用pmodels . 我在网上到处搜索，我能找到的就是定义，它是：“非线性函数中有参数的多列数据框 . 或者包含非线性函数中每个参数的公式的列表“ . 网上有例子，但我没有它的代表 . 例如，对于命令： sel.m2 <- drm(dead/total~conc, type, weights=total, data=seleni... -
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'vmmin'中的drc :: optim初始值不是有限的
我想为 drc R 包中的以下数据拟合 log-logistic 回归 . 但是，我的代码抛出以下错误 . df1 <- structure(list(Temp = c(15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 25L, 25L, 25L, 25L, 30L, 3...