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具有分类预测因子和相互作用的二项Logistic回归（二项式族参数和p值差异）
当我在glm模型中使用交互加上family = binomial参数时以及当我将其遗漏时，我有一个关于重要性和重要性差异的问题 . 我对逻辑回归很陌生，过去只进行了更简单的线性回归 . 我有一个 observations of tree growth rings 的数据集，其中包含 two categorical explanatory variables （ Treatment 和 Origin... -
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从glm中提取pvalue
我正在运行很多回归，我只对一个特定变量的系数和p值的影响感兴趣 . 因此，在我的脚本中，我希望能够从glm摘要中提取p值（获得系数本身很容易） . 我知道查看p值的唯一方法是使用summary（myReg） . 还有其他方法吗？ 例如 . ： fit <- glm(y ~ x1 + x2, myData) x1Coeff <- fit$coefficients[2] # only re... -
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在表格中呈现Tukey HSD成对p值
我在我的数据上运行了一个posthoc Tukey HSD，它有十个因子级别 . 该表非常庞大，我希望在成对表中将p值呈现给读者，留下附录的45行表 . 这是一个示例数据集： set.seed(42) x <- rnorm(100,1,2) category <- letters[1:10] data <- cbind.data.frame(x, category) summar... -
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微阵列数据的多个配对t检验
我正在研究来自同一患者的转移和主要肿瘤中数千个基因的mRNA表达数据 . 从多发转移的患者中，所有转移灶都获得单独的数据 . 该表看起来像下面的那个 . Subjects Type GeneA GeneB GeneC A Met 1 2 5 A Main 3 6 43 B Met 5 ... -
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如何获得ks测试和t检验的p值矩阵？
我是R的新人 . 如果你能帮助我那将是伟大的 . 我的问题如下： 假设我有5个组，Group1，Group2，Group3，Group4和Group5，每个组包含100个数据点 . 现在我想使用t-test或ks-test将这些组相互比较，并希望生成p值矩阵 . 基本上，存在5x5的p值矩阵 . 我使用 corr.mat 函数完成了类似的相关工作 . 这里，5组只是为了说明的目的，在一天结束时，我... -
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相关矩阵与R中的显着性检验
我想知道在R中是否已经有一个可以用SPSS或Statistica进行显着性测试的相关矩阵？目前，我不得不生成一个相关矩阵（使用 ggplot2 geom_tile ）并使用 cor.test 分离显着性测试 . 将两者合并为一个图形会很棒 . 这是我正在使用的真实数据的子集 . X Var2 CorrValue pValue 1 AAAA ... -
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相关系数的Bootstrap p值（重采样方法）
我有这个大的数据集（N = 300.000）并且通过功率分析我得出的结论是，如果它存在，我只需要250个观察来找到相关性 . 因此，我想使用自举来挑选1000个大小为n = 250的样本，以找到这1000个样本中的p值范围 . 我对bootstrap方法很不熟悉，但是在这里我给出了一个关于我在启动包中有多远的例子 . 我用Iris数据集来说明 . 我想要的输出是直方图，显示1000个获得的p值的频... -
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通过p值和皮尔逊相关项来评估预测
我正在使用R对两种不同的预测模型进行一些评估 . 评估的基本思想是使用cor . （）函数比较Pearson相关性和相应的p值 . 下图显示了相关系数的最终结果及其p值 . 我们建议具有较低相关系数和相应较低p值（小于0.05）的模型更好（或者，相关系数更高但具有相当高的相应p值） . 所以，在这种情况下，总的来说，我们会说model1比model2更好 . 但问题是，是否还有其他具体的统计方法... -
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从相关矩阵中提取特定的成对相关性，并为相应的显着性水平添加适当数量的星号
我正在从一个更大的矩阵创建一个具有特定相关性的（apa）表，如果相关性很大，我还想添加一个星号 . 我使用Hmisc包来创建所有可能的相关性和相应的p值 . 然后我使用MOTE包来舍入相关性并摆脱前导零 . 然后我将p值更改为星号 . 我把那些感兴趣的相关性拉出来并把它们放在一个新的矩阵中 . 假设我只想创建一个新的相关矩阵（3乘4），其中'am'，'gear'和'carb'定义3行，'mpg'，... -
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Manova Strange P值
我在这方面工作了一天，并希望你们能对这个奇怪的事情做出暗示 . y0，y1和y2通过相同的方法独立生成 . 它们通过相同的方法分成20组 . 然而，manova说它们有很大的不同？为什么？ Manova测试（存储在变量s中）的摘要说： Pr（> F）值小于2.2e-16 . y0 <- runif(100, 0, 1) y1 <- runif(100, 0, 1) y2 <... -
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R：使用模拟计算p值
我编写了这段代码来对两个随机分布的观察x和y运行一个测试统计 mean.test <- function(x, y, B=10000, alternative=c("two.sided","less","greater")) { p.value <- 0 alternative <- match.arg(alternat...