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导入rpy2.robjects会出错

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我有一个包含1000万条记录的数据 . 我有一个R代码，需要使用3000次迭代估计模型的系数 . 在这些数据上运行R代码非常耗时，有时我的系统会挂起 . 我使用Windows 8.1-64位版本与4 GB RAM . 为了减少时间，我想将R与Python集成 . 虽然我对R有一定的知识，但我在Python中是全新的 . 我发现rpy2可以用来从python调用R（我有python版本3.4.1） . 我做了以下事情：

import rpy2

将rpy2.robjects导入为robjects

但是是给出以下错误：

回溯（最近一次调用最后一次）：文件“C：\ Python34 \ lib \ site-packages \ rpy2 \ rinterface__init __ . py”，第29行，在0，win32con.KEY_QUERY_VALUE）pywintypes.error：（2，'RegOpenKeyEx'，'该系统找不到指定的文件 . '）

在处理上述异常期间，发生了另一个异常：

回溯（最近一次调用最后一次）：文件“”，第1行，在导入rpy2.robjects中作为robjects文件“C：\ Python34 \ lib \ site-packages \ rpy2 \ robjects__init __ . py”，第15行，在import rpy2.rinterface中作为rinterface文件“C：\ Python34 \ lib \ site-packages \ rpy2 \ rinterface__init __ . py”，第32行，除了ImportError（ie）：NameError：name'ie'未定义

我无法理解为什么我会收到错误 . 如何克服错误 .

但是，如果我执行以下操作，它的工作原理是：

来自rpy2 import *

如果有人解释如何精心调用Python中的R并为我的问题提供解决方案，将会非常有帮助 . 关于如何以较短的时间在R中运行大数据的任何其他解决方案也将受到赞赏 . 提前致谢！

python r python-3.x bigdata

2 回答

  • 1

    与使用Python 2.7和R3.1.1在Win7 x64中运行完全相同的问题

    1）安装pywin32：http://sourceforge.net/projects/pywin32/
    2）添加环境变量R_HOME：[R的路径，而不是/Rx.x/bin]

    我在导入时仍然遇到"Unable to unlink tempfile"的问题，但我能够完成这里概述的一些演示：http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-dev/html/introduction.html

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  • 1

    我有一个类似的问题，因为我的环境没有正确设置， import win32api 会引发 ImportError: DLL load failed: The specified module could not be found . 通过添加到我的 PATH 包含我的 python.exe 的文件夹来修复它 .

    请注意，异常 NameError: name 'ie' is not defined 是rpy2中的一个错误，它隐藏了由于无法导入 win32api 或 win32con 而触发的实际异常 .

    然而我之后又有另一个例外（ RuntimeError: R_HOME not defined ），所以我最后添加了一个 R_HOME 变量（= C:\Program Files\R\R-3.1.2 ），如另一个答案中所建议的那样（我也有 Unable to unlink tempfile 警告，我想这还没有修复，请参阅rpy2 windows Unable to unlink tempfile和https://bitbucket.org/lgautier/rpy2/issue/132/rpy2-windows-unable-to-unlink-tempfile）

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