我正在尝试运行R脚本（特别是，我正在使用Bioconductor包中的"getLineages"函数，Slingshot .
我想知道为什么当我使用这个函数时出现错误“向量内存耗尽（限制达到了？）”，因为与这个包中的其他函数相比，它似乎不是最耗费内存的函数（带有我正在分析的数据） .
我确实理解在Stackoverflow上还有其他类似的问题，但他们都建议切换到64位版本的R.但是，我已经在使用这个版本 . 到目前为止，这个问题似乎没有其他答案，我想知道是否有人知道？
数据大小只有120mb，远远低于我电脑的8GB内存 .
1 回答
对于那些使用Rstudio的人，我发现在多个StackOverflow帖子上建议的设置
Sys.setenv('R_MAX_VSIZE'=32000000000)仅适用于命令行，并且在使用Rstudio时设置该参数不会阻止此错误：Error: vector memory exhausted (limit reached?)在做了一些阅读之后，我找到了this thread，它澄清了Rstudio的问题，并确定了一个解决方案，如下所示：
第1步：打开终端，
第2步：
第3步：将以下内容保存为
.Renviron的第一行：注意：此限制包括物理和虚拟内存;因此，在具有16Gb物理内存的计算机上设置_MAX_VSIZE = 16Gb可能无法阻止此错误 . 您可能必须使用此参数，具体取决于您的机器的规格