首页 文章
  • 7 votes
     answers
     views

    通过roxygen2在R文档中生成具有多个参数的项目

    要生成R文档文件( .Rd ),我使用包Rt.2.2,Linux 3.11,devtools 1.5,roxygen2 4.0.1的软件包RStudio / Document选项 . 目标 我想在文档文件中描述函数的多个参数,例如在此示例中: \arguments{ \item{arg1, arg2}{Description} } 这里,参数 arg1 和 arg2 由空格字符分隔 . 这导...
  • 1 votes
     answers
     views

    R CMD检查 - 包可以安装但不能加载

    我创建了一个名为 letstrythis 的测试包来说明问题 . 测试包非常简单,包含以下文件: DESCRIPTION Package: letstrythis Title: What the Package Does (one line, title case) Version: 0.0.0.9000 Authors@R: person("Mike", "Sm...
  • 21 votes
     answers
     views

    将闪亮的应用程序开发为一个包并将其部署到闪亮的服务器上

    我正在开发一个闪亮的应用程序,因为我想使用该功能的自动化测试和文档,我开始在一个包中开发接口(如推荐here) . 我在RStudio中开发了这个闪亮的应用程序,我有一个 server.R 文件,我可以点击RStudio中的 Run App 按钮,一切正常 . 我将我的包提交到github存储库,从这一点开始,我想使用 devtools 和 install_github 函数将它安装在我的R闪亮服...
  • 0 votes
     answers
     views

    从私人仓库包安装问题

    我对这里缺少的东西感到有点困惑 . 我有一个私人R包 . 我想用 devtools::install_git('myaccount/myprivate_package') 安装 我收到以下错误: Installation failed: Error in 'git2r_clone': unsupported URL protocol 我做了一些搜索,似乎在谈论这个git2r软件包丢失了(不是),...
  • 22 votes
     answers
     views

    如何使用devtools install_github从私有仓库安装R包?

    我正在尝试从我的github仓库安装一个示例包: https://github.com/jpmarindiaz/samplepkg 我可以通过R解释器使用以下任何命令公开repo时安装它: install_github("jpmarindiaz/rdali") install_github("rdali",user="jpmarindiaz...
  • 6 votes
     answers
     views

    R的devtools - 使用“configure”文件从github安装

    我在github上有一个使用“configure”脚本的R包(因为一些C代码依赖于GSL库) . 我尝试使用devtools包中的github_install()函数安装包,并获取错误: (as ‘lib’ is unspecified) * installing *source* package ‘wrightscape’ ... ERROR: 'configure' exists but is...
  • 1 votes
     answers
     views

    使用devtools从github安装R包的问题

    与以下问题类似: Error when using install_github: 'exdir' does not exist 我似乎无法使用 devtools 软件包从github安装软件包,在我尝试的所有软件包上得到以下错误(slidify,rCharts,rga,magrittr等...): Error in unzip(src, list = TRUE) : zip file 'C...
  • 1 votes
     answers
     views

    R包:递归地安装依赖项

    我正在尝试使用devtools(更确切地说, install_github )从Github安装我的一个R包 . 但是,即使我将参数 dependencies 设置为 TRUE ,也不会递归安装依赖项 . 也就是说,没有安装依赖项的依赖项 . 因此,未安装包 . R发送一条消息,说它无法找到其中一个依赖项 . 它一直发送这些消息,直到我安装所有内容 . 这是标准行为吗?或者我错过了什么?我正在谈...
  • 0 votes
     answers
     views

    使用install_github在分支上安装软件包时出错

    我从github分叉了一个包,做了一些改动 . 我正在尝试安装我使用install_github()进行更改的软件包版本,但收到错误消息 . 有什么建议? 分叉版本:https://github.com/embruna/refnet 分支上编辑的版本:https://github.com/embruna/refnet/tree/proposed-updates 我可以安装forked版本: ins...
  • 4 votes
     answers
     views

    导入的包不会自动安装

    我有一个本地存储的私有包(并通过SVN进行版本控制) . 要安装软件包,我要求用户SVN更新他/她的软件包目录,然后在目录上更新 setwd() ,然后 devtools::install() . 此程序包导入许多CRAN程序包,这些程序包不存储在本地 . 这些导入的包在安装过程中不会自动安装,从而产生错误消息 Dependency package foo not available . 用户...
  • 0 votes
     answers
     views

    从Github安装R包时遇到问题

    请耐心等待我,因为我是一个完全的菜鸟,但我真的很想学习 . 我正在尝试为我的国家制作一张 choropleth Map ,并在Github上找到了一个可以很好地处理它的R包 . 但是,我在任何驱动器上都有写权限,但M://,所以每当包尝试在C://上安装时,它显然会抛出错误 . 这不是问题,因为我可以在install.packages上指定一个libpath作为参数,但是devtools :: ...
  • 0 votes
     answers
     views

    从GitHub安装R packge - “'''在当前工作目录中不存在

    我已经构建了一个新的包,它在github.com/kevinwolz/hisafer上的GitHub上托管 . 我试图通过devtools :: install_github()安装包,但我得到了一个非常错误 . 救命? >install_github("kevinwolz/hisafer") Downloading GitHub repo kevinwolz/hisa...
  • 2 votes
     answers
     views

    无法使用install_github()安装IRkernel:Git没有安装?

    我试图让R在我的Windows机器上使用Jupyter Notebook . 我跟着IRkernel tutorial . 但是,我无法安装GitHub存储库,我总是得到错误 install_github("IRkernel/IRkernel") Downloading GitHub repo IRkernel/IRkernel@master Error: Git does n...
  • 1 votes
     answers
     views

    由于rJAVA,devtools :: check()报告错误

    在Rstudio中,我在我的项目中运行 devtools:check() ,发生以下错误 错误:.onLoad在'rJava'的loadNamespace()中失败,详细信息:call:library.dynam(“rJava”,pkgname,libname)错误:找不到DLL'rJava':可能没有为此架构安装? 在发生此错误之前,我很确定我使用 install.packages('rJa...
  • 1 votes
     answers
     views

    在R中,我如何从包中的导入类中继承对象?

    我正在研究R包并导入某个库 . 我正在创建一个从导入的库继承类的类 . 在我的DESCRIPTIONS文件中,我有: ... Imports: importedPackage 然后我有一个 class 声明: setClass("mySampleClass", slots = list( numUp = "numeric",...
  • 0 votes
     answers
     views

    R的h2oEnsemble软件包安装出错

    我正在尝试在R 3.2.3上安装h2oEnsemble包 . 我有H2O 3.10.0.8包 . 当我写这些命令时: library(devtools) install_github("h2oai/h2o-3/h2o-r/ensemble/h2oEnsemble-package") 我收到下一个错误: Downloading GitHub repo h2oai/h2o-3@ma...
  • 4 votes
     answers
     views

    从package-internal packrat库加载依赖项

    我正在用packrat构建一个R包 . 该软件包已经过本地保存的源文件的全面测试和安装 install.packages("myPackage.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 如果所有依赖项(在Imports:字段中指定)都安装在本地计算机上,则可以正常工作 . 但是,我想在另一台未安装依赖项的服务器上安装该...
  • 0 votes
     answers
     views

    Virusscanner用木马警告删除devtools包?

    我正在尝试使用 install.packages("devtools") 安装devtools包: 将软件包安装到'C:/Users/RenR/Documents/R/win-library/3.2'(未指定'lib'),同时安装依赖项'httr','rstudioapi','withr'有二进制版本可用但源版本稍后:二进制源needs_compilation httr 1....
  • 1 votes
     answers
     views

    包依赖性错误“没有名为'stringi'的包

    我创建了一个R包并将其加载到github(microdadosBrasil) . 当我尝试安装包(作为用户)时,我收到以下错误: devtools::install_github("lucasmation/microdadosBrasil") Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI...
  • 7 votes
     answers
     views

    install_github是否以递归方式安装依赖项?

    R包 devtools 似乎是使用 install_github() 函数直接从其github存储库安装R包的首选方法 . 在这样做的同时,不仅安装了已解决的github-package,而且还安装了直接的CRAN依赖性,即包的Description / Namespace文件中定义的Depends和Imports . 但是,我想知道是否需要间接需要的包,例如Depends和Imports包所需的...
  • 0 votes
     answers
     views

    是否可以在下载时为R包安装外部依赖项

    我有一个R包,它对github上的C库有某些依赖关系,目前没有repo中的依赖C库 . 通常,我会使用以下命令从GitHub安装R包: install.packages("devtools") library(devtools) install_github("github_repo/package_name") R包使用的所有C代码自然位于子文件夹 pa...
  • 2 votes
     answers
     views

    创建R包:错误:安装包索引失败

    令人惊讶的是,我没有看到以前的SO清楚地讨论这个问题 . 我正在创建一个R包 . 所有依赖项都已安装 . 源代码(据我所知)正确注释了roxygen2 . 在包根目录中,以下命令成功: 记录包装工作原理: > devtools::document() 构建包工作: > devtools::build() 安装包失败: > devtools::install() ** R ** d...
  • 7 votes
     answers
     views

    错误设置证书验证位置,install_github

    我正在尝试从github安装一个包,但是当我使用 install_github 时,我一直收到错误 . library(devtools) install_github(repo="swirl", username="ncarchedi") Installing github repo(s) swirl/master from ncarchedi Downl...
  • 0 votes
     answers
     views

    R cran无法从devtools的install_github递归安装依赖项

    我尝试用Windows 7测试在Ubuntu 16.04上开发的软件包 . 对于这两个平台,我都使用R 3.3.1(但我也在3.3.0上测试) . 我的包保存在我的GitHub仓库(https://github.com/charlottesirot/elementR)上 . 当我从Ubuntu运行此命令时,没有问题发生: library(devtools) install_github(&...
  • 6 votes
     answers
     views

    R:如何通过install_github()安装特定版本?

    如果包的当前版本出现一些错误,则用户可能更愿意安装特定版本(例如版本1.0.1) . 可以用什么样的R代码来实现呢? 举例来说,发布最新的 OhdsiRTools R软件包: https://github.com/OHDSI/OhdsiRTools/tree/v1.0.1 命令如下: install_github("OHDSI/OhdsiRTools", ref = 'v1....
  • 0 votes
     answers
     views

    使用R:github 'okugami79/sentiment140'包安装错误的情感分析

    我希望开发者okugami79安装sentiment140 github软件包 . 我写了以下脚本: install.packages("githubinstall") require(devtools) library(githubinstall) install_github('sentiment140', 'okugami79') library(sentiment) ...
  • 4 votes
     answers
     views

    devtools / GitHub下载错误

    截至今天,我无法使用 devtools 从GitHub安装软件包 . 我不知道错误是否在于: 我 devtools GitHub 我正在使用如下的 install_github 并收到以下错误: library(devtools) install_github("reports", "trinker") ## > library(de...
  • 1 votes
     answers
     views

    Devtools安装github pkg:loadNamespace出错:没有调用包

    我试图在一段时间内第一次安装我自己的github包: install.packages("devtools") library(devtools) install_github("SimonDedman/gbm.auto") 但我得到: Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCh...
  • 14 votes
     answers
     views

    devtools :: install_github因CA证书错误而失败

    当我尝试调用install_github时,我收到以下错误(不仅是这个包,而是所有github包): > install_github('ramnathv/slidify') Downloading github repo ramnathv/slidify@master Error in curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) : Prob...
  • 11 votes
     answers
     views

    通过devtools install_github安装r包的问题

    我正在GitHub上开发两个包,我正在尝试使用 devtools::install_github() 命令安装它们 . 由于存储库是私有的,我为我的帐户创建了一个 auth_token (据我所知,单个存储库没有办法做到这一点?) devtools::install_github("mariodejung/rMQanalysis", ...

热门问题