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在LINUX环境中为R安装RMySQL时出错
我正在尝试将R（Linux）与MySQL连接，但我收到此错误 . 错误：包'RMySQL'的配置失败*删除'/home/yogesh/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4/RMySQL'在install.packages中的警告：包'RMySQL'的安装具有非零退出状态 下载的源包位于'/ tmp / RtmpYEA0LH / downloaded_packa... -
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在我的软件包中使用ddply时，如何摆脱R CMD检查生成的NOTE？
我有一个与How can I handle R CMD check "no visible binding for global variable" notes when my ggplot2 syntax is sensible?相似但又不同的问题 . 在那种情况下，通过使用aes_string而不是aes，一切都顺利进行 . 然而，这与plyr afaik无法实现 . 例如... -
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在R包中导入鼠标功能时出错
我想在我的包中包含mice :: mice函数来对我的数据进行插补 . 我使用Roxygen列出进口 #' @param data dataset to be used for imputation #' @importFrom dplyr select_ #' @importFrom mice mice complete #' @return A list #' @export #' impu... -
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setkey（）生成关于R CMD检查的注释 - 没有可见的全局变量绑定
我创建了一个R包并将其提交给CRAN . CMD检查输出1注意： fun：全局变量'id'没有可见的绑定 CRAN建议我解决它 . fun（）（我的一个函数）是一个自定义导入来读取由另一个软件创建的文件 . 这些文件是非常大的数据集 . 因此，由于我正在优化导入，因此我使用data.table和set key，这不仅有助于提高性能，还需要运行后续函数，例如foverlaps（） . 我正在使... -
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R CMD检查 - 包可以安装但不能加载
我创建了一个名为 letstrythis 的测试包来说明问题 . 测试包非常简单，包含以下文件： DESCRIPTION Package: letstrythis Title: What the Package Does (one line, title case) Version: 0.0.0.9000 Authors@R: person("Mike", "Sm... -
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从package-internal packrat库加载依赖项
我正在用packrat构建一个R包 . 该软件包已经过本地保存的源文件的全面测试和安装 install.packages("myPackage.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 如果所有依赖项（在Imports：字段中指定）都安装在本地计算机上，则可以正常工作 . 但是，我想在另一台未安装依赖项的服务器上安装该... -
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包依赖性错误“没有名为'stringi'的包
我创建了一个R包并将其加载到github（microdadosBrasil） . 当我尝试安装包（作为用户）时，我收到以下错误： devtools::install_github("lucasmation/microdadosBrasil") Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI... -
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是否可以在下载时为R包安装外部依赖项
我有一个R包，它对github上的C库有某些依赖关系，目前没有repo中的依赖C库 . 通常，我会使用以下命令从GitHub安装R包： install.packages("devtools") library(devtools) install_github("github_repo/package_name") R包使用的所有C代码自然位于子文件夹 pa... -
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创建R包：错误：安装包索引失败
令人惊讶的是，我没有看到以前的SO清楚地讨论这个问题 . 我正在创建一个R包 . 所有依赖项都已安装 . 源代码（据我所知）正确注释了roxygen2 . 在包根目录中，以下命令成功： 记录包装工作原理： > devtools::document() 构建包工作： > devtools::build() 安装包失败： > devtools::install() ** R ** d... -
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递归R包安装失败
我'm debugging the reason why installing one'自己的软件包无法安装 Import -ed软件包 . 选择合适的根目录 . 在该目录中启动R会话 . library(devtools) 之后，运行 devtools::create("mypackage") . 将以下行保存在文件 mypackage/R/f.R 中 . @... -
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所需的包不会自动安装
我创建了我的第一个R包，并有一个问题 . 包在我的计算机上成功运行 . 但是，如果我的用户（没有所需的软件包）运行我的软件包，他们将收到错误消息，说明所需的软件包不可用 . 当他们从CRAN手动安装该软件包时，我的软件包就可以运行了 . 根据Hadley Wickam的书（http://r-pkgs.had.co.nz/description.html）： 导入：此处列出的软件包必须存在才能使您... -
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从私人仓库包安装问题
我对这里缺少的东西感到有点困惑 . 我有一个私人R包 . 我想用 devtools::install_git('myaccount/myprivate_package') 安装 我收到以下错误： Installation failed: Error in 'git2r_clone': unsupported URL protocol 我做了一些搜索，似乎在谈论这个git2r软件包丢失了（不是），... -
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R包：递归地安装依赖项
我正在尝试使用devtools（更确切地说， install_github ）从Github安装我的一个R包 . 但是，即使我将参数 dependencies 设置为 TRUE ，也不会递归安装依赖项 . 也就是说，没有安装依赖项的依赖项 . 因此，未安装包 . R发送一条消息，说它无法找到其中一个依赖项 . 它一直发送这些消息，直到我安装所有内容 . 这是标准行为吗？或者我错过了什么？我正在谈... -
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导入的包不会自动安装
我有一个本地存储的私有包（并通过SVN进行版本控制） . 要安装软件包，我要求用户SVN更新他/她的软件包目录，然后在目录上更新 setwd() ，然后 devtools::install() . 此程序包导入许多CRAN程序包，这些程序包不存储在本地 . 这些导入的包在安装过程中不会自动安装，从而产生错误消息 Dependency package foo not available . 用户... -
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R CMD检查不识别S3泛型方法
我正在编写一个包，如果我在我的Rstudio中运行它运行但是当我将它提供给R CMD检查运行时，它无法识别S3方法 . 我有一个通用的方法： count_kmers <- function(obj, klen = 6, parallel = TRUE, nproc = ifelse(parallel, comm.size(), 1), ...