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使用`scipy.integrate.odeint`时出错

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我正在使用函数 scipy.integrate.odeint ,但是我收到了意外错误 . 我的代码如下:

import numpy as np
from scipy.integrate import odeint

def hyper_exp_ODE(y, s, λ, k, μ, p):
    F, H = y
    C_bar_s = 1 - (1 - F) **k
    rhs = [-λ * np.sum(p * μ * H) + λ * C_bar_s]
    rhs.extend([-μ[i] * H[i] + C_bar_s for i in range(len(μ))])
    return rhs

def limit_hyper_exp(S, λ, k, N, μ, p):
    S_range = np.linspace(0,S,N)
    y0 = (1-λ, np.zeros(len(μ)))
    sol = odeint(hyper_exp_ODE, y0, S_range, args = (λ, k, μ, p))
    return sol, S_range

S = 10
λ = 0.8
k = 2
N = 100
μ, p = np.array([2.0, 1.2]), np.array([0.2, 0.8])

sol, S_range = limit_hyper_exp(S, λ, k, N, μ, p)

我出乎意料地得到了错误 ValueError: setting an array element with a sequence. ,之前我使用过非常相似的代码但是没有向量化我明确地键入了所有内容,但这段代码似乎与我相同(但显然不是) .

1 回答

  • 1

    问题是这一行:

    y0 = (1-λ, np.zeros(len(μ)))
    

    这使得 y0 一个长度为2的元组包含一个标量和一个numpy数组 . 当 odeint 中的代码尝试将其转换为numpy数组时,会发生错误 . 例如,

    In [7]: y0 = (1, np.zeros(4))
    
    In [8]: np.array(y0)
    ---------------------------------------------------------------------------
    ValueError                                Traceback (most recent call last)
    <ipython-input-8-9a58cb72863b> in <module>()
    ----> 1 np.array(y0)
    
    ValueError: setting an array element with a sequence.
    

    你可以用类似的东西创建 y0

    y0 = [1-λ] + [0]*len(μ)
    

    要么

    y0 = np.zeros(len(μ) + 1)
    y0[0] = 1-λ
    

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